新型MetaboBASE Personal Library提高分析人員深入進行代謝物鑒定的信心
分析測試百科網訊 2016年6月6日—在ASMS 2016會議上,Bruker推出最新質譜數據庫,被稱為Bruker MetaboBASE Personal Library?,該數據庫包括超過13000種化合物的高分辨率、精確質量MS/MS譜圖,其中包含內源性代謝物、藥物和多肽類化合物等。
這些代謝物包括在寬動態范圍下的基于復雜基質的小分子化合物。如前所述的這些已知目標代謝物,獲取這些代謝物數據的相關生物學信息是必不可少的,以更加深入的進行鑒定分析。這些已知代謝物信息的自動化獲取變得至關重要。該數據庫包含的內源性和外源性代謝物,可自動匹配對應的MS/MS譜圖。
Bruker MetaboBASE Personal Library?是由布魯克與加利福尼亞州拉霍亞,斯克里普斯代謝組學中心的Gary Siuzdak教授共同合作研發的。Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士都是著名的代謝組學領域研究人員,數據庫中裝載了從布魯克高分辨、精確質量QTOF質譜中獲取的超過13000種標準物質MS/MS譜圖。
Bruker MetaboBASE
Personal Library?自動鑒定代謝物
數據庫中的數據是從混合或單個標準獲得的,包含除了內源性和外源性代謝物之外的二肽和三肽化合物。所有譜圖是通過使用不同的碰撞能量的正負模式下采集的。補充數據包括數據庫IDs和外部數據庫的超鏈接,包括HMDB,KEGG和PubChem數據庫,這使得研究人員能夠快速地將所確定的代謝物帶到一個生物環境中去。
布魯克道爾頓代謝組學市場經理Dr. Aiko Barsch評價:“相比在本地PC機獲取的布魯克QTOF高分辨率、精確質量(HRAM)MS/MS數據,Bruker MetaboBASE Personal Library?已經允許對已知化合物進行自動化鑒別。以此為基礎鏈接到HRAM-MS/MS數據,可以協助我們的客戶跟深入地了解代謝組學方面的研究。”
來自加利福尼亞州拉霍亞,斯克里普斯代謝組學中心的Gary Siuzdak教授表示:“我們最近安裝了Bruker impact QTOF儀器,具有較高的分辨率,讓我們獲得了精確的MS/MS數據庫。我們可以自信地說,Bruker MetaboBASE Personal Library?能夠快速自動識別已知化合物。”
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