去年夏天西非埃博拉爆發的早期階段,科學家們以空前的規模和速度測序了這種致命病毒的基因組,為人們揭示了許多疫情蔓延的關鍵信息,比如說病毒只通過人與人接觸傳播,病毒在多次傳播中獲得了許多新突變等等。
雖然埃博拉爆發最糟糕的時期已經過去,但這場疫情并未結束,還有許多問題需要人們去解答。為此,哈佛大學、Broad研究所、美國疾控中心(CDC)、美國國家過敏和傳染病研究所(NIAID)等研究機構測序了兩百多個埃博拉病毒樣本的基因組,進行了迄今為止最全面的分析。這項研究發表在六月十八日的Cell雜志上,展示了病毒在這么長時間里發生的改變。
“我們之前的工作反映了埃博拉爆發后三周的病毒行為,”文章的資深作者Sabeti說。“現在這項研究跟蹤了病毒在七個月內的變化,有助于理解埃博拉的長期演化。”
“這些高分辨率的測序數據顯示,在埃博拉疫情爆發的后期,病毒跨境傳播是非常少的,”文章第一作者Danny Park指出。“這是一個重要的信息,因為塞拉利昂、利比里亞和幾內亞(三個受疫情影響的主要國家)的國境被認為是千瘡百孔的。”
跨境行為在埃博拉爆發初期推動了疫情的發展,但后來病毒并沒有像人們預測的那樣遷移,Park說。“在國境上實施的控制措施的確有效,這是令人欣慰的好消息,”他說。“人們也應當把關注國內的遷移行為。”
研究人員通過測序分析了埃博拉在持續性爆發中出現的演化。隨著病毒在早期階段快速擴散,它們累積了許多突變,其中有不少可以影響蛋白質功能。去年的測序研究表明,這些突變大多對病毒是有害的,但當時疫情持續的時間還不長,不足以通過自然選擇將其清除。
現在研究人員看到,許多突變并沒有存留多久,病毒的基因組變化速度符合人們的預期。“這一次埃博拉在人類中傳播得最久規模也最大,它已經開始清除對自己不利的突變了,” Park說。
這項研究還證實了人們的一些其他推測,比如說有患者體內出現了人類酶編輯病毒基因組的現象。這是首次在埃博拉中發現這類事件,該事件一般只出現在和人類長期互作的病毒中。
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