Cell子刊發布首個植物轉錄因子文庫

　　近日科學家們借助自動化平臺，建立了首個植物遺傳學開關的綜合性文庫，以幫助全球學者更好的理解植物對環境改變的適應，培育更好的植物品種。相關論文于七月十七日發表在Cell旗下的Cell Reports雜志上。

　　該文庫的建立耗時八年，包含大約兩千個植物轉錄因子的克隆。轉錄因子是天然的遺傳學開關，研究者們可以通過操作這些轉錄因子改善植物的關鍵性狀，例如耐寒性和種子的量。

　　 “轉錄因子能夠進入細胞核，結合到特定的DNA序列上，”文章的通訊作者，南加州大學的Dornsife文理學院院長Steve Kay說。“它們能夠根據細胞適應環境的需求，控制基因的開關，調節基因的活性。”

　　基因啟動子上結合的轉錄因子組合，是轉錄水平的重要決定因素。轉錄因子與啟動子的互作，形成了轉錄調控網絡的基礎。

　　植物研究得到的資助比生物醫學研究少得多，而Kay希望這項研究能為資金并不充裕的植物研究提供幫助。該文庫中的克隆都來自開花植物擬南芥，其克隆儲存在微孔板中，可以發送給世界各地的科學家。

　　“我們想要構建高保真度的金標轉錄因子文庫，服務于全球的植物研究群體，”Kay說，他主要在植物中進行生物鐘研究。“擬南芥可以看作是植物界的小白鼠，我們從果蠅和小鼠中了解了不少人體的生物過程，同樣我們也通過擬南芥學到了許多有關生物鐘的知識。”

　　文章的共同第一作者Jose L. Pruneda-Paz認為，轉錄因子文庫將“最終幫助我們在分子水平上理解植物的功能機制。”

　　Pruneda-Paz和文章的另一位共同第一作者Ghislain Breton，在2006年首次想到要構建這樣一個文庫。當時他們正在針對CCA1和LHY的生成，研究植物對明暗循環的適應機制。CCA1和LHY是兩個調控擬南芥生物鐘基因的轉錄因子。

　　傳統的基因功能研究是，給基因引入突變看看是否會影響某種表型，但在這種情況下該方法并不奏效。于是研究人員決定采用“相反的策略”，“我們決定克隆所有的轉錄因子，然后看哪個轉錄因子結合和調控CCA1的表達。就這樣我們開始了文庫的構建工作，”Pruneda-Paz解釋道。

　　據Breton介紹，該文庫在歐美已經衍生出了70個研究項目。