This page should point you to the many different general and lab-specific protocols describing tissue and cell lysis and serve as forum for comparison. The ups and downs of various methods from sonication, homogenization, freeze-thaw cycles, and detergent-based lysis are examined below.
most efficient method of cell fractionation
problem: heat build up which can denature proteins (proportionate to length of sonication)
precaution: do on ice and sonicate intermittantly
material: ultrasonication bath or rods
best for animal tissue; less suitable for cells
precaution: do on ice to reduce heat build-up and denaturation
material: drills (polytron), pestle/tube (dounce) bead beaters
least effective method
plus: does not denature proteins as much as other methods
material: pestle and mortar, liquid nitrogen
chemical method of lysis
problems: detergent may inhibit subsequent reactions
problems: detergent may disrupts protein interactions
no additional material required, just the chemicals and typical tubes
| description/link | target | lysis method | type of material |
|---|---|---|---|
| Silver: Lysate for Western | protein | detergent (Triton) | cells |
| Sauer:Lysing E. coli with Lysozymes | lysozyme | bacteria | |
| Blackburn:Yeast Colony PCR | DNA | NaOH | yeast |
| Jacobs:Protocol Total Protein Isolation Using RIPA Lysis Buffer | protein | detergent (RIPA buffer) | cells |
| Streptomyces:Protocols/Mini-Maxi Prep | DNA | NaOH | bacteria |
| Western Blot/Tissue Preparation | protein | detergent & physical disruption | tissue |
| Eccles:Protein Lysates from Cells in Culture | protein | detergent (SDS, NP40) | cells |
| Eccles:Protein Lysates from Tissue | protein | detergent, physical, freezing | tissue |
| RNA extraction using trizol/tri | RNA | phenol | cells |
| Sauer:RNA Purification from E. coli | RNA | various options | bacteria |
| add another method''s name | target | lysis method | type of starting material |
文｜《中國科學報》記者李思輝實習生何睿她是一位知名三甲醫院的科室主任：不僅負責科室的管理工作，而且每周4個半天坐診，每年主刀800多臺手術；她是院士師門的“大師姐”：繁忙的臨床工作之余，做研究、帶學生......
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葉綠體蛋白在ATP酶馬達的驅動下，通過葉綠體外膜(TOC)轉座子和葉綠體內膜(TIC)超復合體的轉座子導入。Ycf2-FtsHi復合體已被確定為葉綠體進口馬達。然而，其在前蛋白轉運過程中與TIC復合物......
文| 《中國科學報》記者李思輝實習生畢若雪“2021年暑假的一個凌晨，我突然靈機一動，思考了很久的一個模型突然清晰起來。我立即從床上蹦起來，花了5分鐘，在紙上把它清楚地畫了出來！”說起最近發......
“一稿多投”一直被認為是不端的行為，但這個“規矩”是在紙質時代信息溝通不暢的情況下制定的，近年來廣大作者呼吁取消這一觀念的聲音已振聾發聵！讓人欣喜的是，截止目前，已經有兩大國際知名出版社響應了這一呼吁......
2024年4月23日，北京理工大學生命學院肖振宇副教授、中國科學院動物研究所王紅梅、于樂謙、郭靖濤研究員、中國農業大學魏育蕾教授、鄭州大學第一附屬醫院何南南助理研究員在國際學術期刊Cell發表文章《3......
2019年10月3日，加州大學圣地亞哥分校BrendaL.Bloodgood團隊（G.StefanoBrigidi為第一作者）在Cell在線發表題為“GenomicDecodingofNeuronal......
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RNA引導系統利用引導RNA和靶核酸序列之間的互補性來識別遺傳元件，在原核生物和真核生物的生物過程中都起著核心作用。例如，原核CRISPR-Cas系統為細菌和古細菌提供了對外來遺傳因子的適應性免疫。C......
大約700萬年前，人類從我們最接近的動物親戚黑猩猩那里分離出來，在進化樹上形成了我們自己的分支。在此后的時間里---從進化的角度看是短暫的---我們的祖先進化出了使我們成為人類的性狀，包括比黑猩猩大得......