腦干網狀結構由椎基底動脈系統供血，包括旁正中、短旋、長旋支等均為穿動脈供血，缺乏側支循環，因而容易受血流灌注壓低下的影響，腦干網狀結構常見的腦血管病與腦其他部位一樣，多為腦出血、腦梗塞和蛛網膜下腔出血。
⑴腦出血。腦干網狀結構所見的腦出血多為高血壓性腦出血，其他尚可有海綿狀血管瘤等腦血管畸形所致腦出血、原發或轉移腫瘤腦出血以及繼發性腦干出血（Duret hemorrhage）等。腦出血后，與網狀結構受損有關的神經征候可出現意識障礙，由于上行性網狀激活系統受損而致不同程度意識障礙甚至昏迷。橋腦至延髓網狀結構的呼吸中樞受損可致各型呼吸障礙，眼球運動障礙可表現為側視注視麻痹、內側縱束征候群或一個半綜合征等。
⑵腦梗死。基底動脈閉塞、腦干全部梗死時可出現昏迷、高熱、腦胃綜合征、去腦強直發作及四肢癱等。如梗死灶較局限，可出現內側縱束癥候群或一個半癥候群。⑶蛛網膜下腔出血。基底動脈瘤破裂所致蛛網膜下腔出血可出現明顯的意識障礙甚至昏迷。各型腦血管病所致腦干網狀結構受損，主要導致意識障礙、眼球運動障礙、眩暈及頑固性呃逆等，恢復較慢，是康復治療的難點。