固體粉末 ：避光，2-8 ℃保存，3年沒有問題。
貯存液 ：用無菌水配制成濃度1 mg/ml 的貯存液，配好后用錫紙包起來，避光，可在-20 ℃下長期保存。（DAPI易溶于水，在PBS中溶解度不高）
使用濃度 ：貯存液用1xPBS稀釋到終濃度100 ng/ml。
熒光封片液 ：0.5 mol/L碳酸鹽緩沖液與甘油等體積混合，pH9.5
染色與觀察 ：制好的玻片上滴加幾滴DAPI染液，染色10分鐘，流水沖去染液，濾紙吸除多余水分，加一滴熒光封片液，置于熒光顯微鏡下觀察，激發波長360-400nm。
注意事項 ：DAPI可能具有致癌性，全部操作過程中必須帶塑料或乳膠手套。