FISH的分辨率取決于載體DNA的濃縮程度，如何提高分辨率一直是一個重要課題。Wiegant等和Heng等首先利用化學方法對染色體進行線性化，再以此為載體進行FISH，使其分辨率顯著提高，這就是最初的纖維-FISH。纖維-FISH應用各種不同技術，將待研究細胞的全部遺傳物質即DNA在載玻片上制備出DNA纖維，用不同顏色熒光物質標記的探針與DNA纖維雜交，在熒光顯微鏡下觀察結果并進行分析。
纖維-FISH的關鍵就在于制備高質量的線性DNA纖維。理想制備出的DNA長度應與完全自然伸展的DNA纖維相近，并且.斷裂點應盡可能少。近年來已發展了多種制備DNA纖維的方法。纖維-FISH能進行定量分析，所需模板量少且要求不高，具有分辨率高和靈敏度高等優點。因此，纖維-FISH在染色體圖譜繪制，基因重組研究以及臨床染色體基因序列檢測工作中起著十分重要的作用。