這種方法的核心部分是,利用末端脫氧核苷酸轉移酶轉移核苷酸的特殊功能。末端脫氧核苷酸轉移酶是從動物組織中分離出來的一種異常的DNA聚合酶,它能夠將核苷酸(通過脫氧核苷三磷酸前體)加到DNA分子單鏈延伸末端的3′-OH基團上。由核酸外切酶處理過的DNA,以及dATP和末端脫氧核苷酸轉移酶組成的反應混合物中,DNA分子的3′-OH末端將會出現單純由腺嘌呤核苷酸組成的DNA單鏈延伸。這樣的延伸片段,稱之為poly(dA)尾巴(圖2-7)。反過來,如果在反應混合物中加入的是dTTP,那么DNA分子的3′-OH末端將會形成poly(dT)尾巴。因此任何兩條DNA分子,只要分別獲得poly(dA)和poly(dT)尾巴,就會彼此連接起來。這種連接DNA分子的方法叫做同聚物尾巴連接法(homopolymertail-joining),簡稱同聚物加尾法。