真核生物中染色體交換促進了減數分裂過程中的DNA重組。交換過程導致后代具有與其親本不同的基因組合，并且偶爾可以產生新的嵌合等位基因。由DNA重組引起的基因改組增加了遺傳變異。
染色體交叉涉及從父母遺傳的配對染色體之間的重組，通常在減數分裂過程中發生。在前期I（粗線期）期間，四種染色單體彼此緊密聚集，兩個配對染色單體上的同源位點可以彼此緊密配對，并可以交換遺傳信息 [1] 。因為重組可以在染色體的任何位置以小概率發生，所以兩個位點之間的重組頻率取決于它們之間的距離。因此，對于在同一染色體上足夠遠的基因，交換量足以破壞等位基因之間的相關性。