膠色譜（GPC）可以將分子體積大小不同的化合物分離，凝膠滲透色譜的分離基礎是溶液中溶質分子的大小不同。這種方法對流動相的要求不高，實驗條件比較溫和，重復性好，分析速度快、溶質回收率高，是最為方便的樣品凈化技術。對食品、動物組織、土壤、中藥的小分子有機物進行分析時，一般樣品的萃取物含有大量的大分子物質，如脂肪、色素等，會極大干擾檢測結果。采用GPC凈化樣品，可除去脂肪、蛋白、色素等大分子干擾物質，保證分析結果的穩定性。
凝膠凈化分離示意圖:
GPC凝膠凈化系統選擇要點：
1、使用雙柱塞恒流泵，比單柱塞恒流泵流量更加穩定，結果準確；
2、具有餾分收集器的凈化系統，可在進樣后無人操作；
3、具有自動進樣器的凈化系統，可將樣品瓶放置后無人操作；
4、自動進樣器帶有刺穿瓶蓋功能，可使用密封樣品瓶，減少樣品損失；
5、凝膠凈化系統與固相萃取聯用，樣品凈化周期更短，自動化程度更高；
6、使用制備色譜泵，樣品制備量選擇更為靈活；
7、使用全波長檢測器，波長選擇更為靈活，檢測范圍更廣；
8、凈化系統的整合性高，則故障少、使用方便；
GPC凝膠凈化系統選擇指南：
GelMaster TM
是上海科哲公司推出的GPC凈化系統品牌，擁有國內最為齊全的產品線，性能國內領先。旗下擁有GelMaster-5000GS、GelMaster-3000、GelMaster-2000、GelMaster-1000四種不同類型的產品，針對于不同類型的客戶。
GelMaster-5000GS型是一種聯用系統，主要面對GPC與固相萃取使用均很頻繁、對實時性要求很高的客戶，如：農藥殘留、獸藥殘留、毒物分析、血藥分析等復雜樣品的前處理，適應食品安全、藥品安全的突發事件的處理，極大的減少分析時間，減少誤差。
GelMaster-3000型實現了從進樣到分離的高度自動化，主要用于樣品數量多，人員較為緊張的實驗室，可以無人化長時間連續操作，大量節約分析人員時間，保證其工作效率。
GelMaster-2000型分離過程實現了自動化，主要用于樣品數量一般，人員較為緊張的實驗室，分析人員可以在純化的過程中，從事其他工作，提高了效率、降低了勞動強度。
GelMaster-1000型結構簡單、維護容易。主要適用于經費較少，樣品較少的實驗室，可以處理少量樣品，而且體積小、搬運容易，也可以用于車載與流動監測。