實驗概要
體外檢測蛋白質與蛋白質之間相互作用。用于驗證兩個已知蛋白的相互作用,或者篩選與已知蛋白相互作用的未知蛋白。
實驗原理
利用重組技術將探針蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在載體上的GTH(Glutathione)親和結合。因此,當與融合蛋白有相互作用的蛋白通過層析柱時或與此固相復合物混合時就可被吸附而分離。
主要試劑
NaCl, KCl,Na2HPO4,KH2PO4,Triton-100,IPTG(Merck分裝),PMSF(Amersco),Cocktaier(Merck 539134),Immobilized Glutathione(PIERCE 15160)
實驗步驟
1. 原核融合蛋白A的獲得
1) 將編碼蛋白A與GST的重組質粒化轉BL21(DE3)菌株
2) 挑取單個克隆到含有5mlLB( 100ug/mlAmp)的10ml試管里,37℃培養過夜
3) 將培養菌液轉移到含有500ml LB( 100ug/mlAmp)的1L錐形瓶中,37℃,225rpm培養至OD600≈1.0-1.5左右,加入適當濃度的IPTG,在適當溫度下培養適當時間(誘導條件需要根據不同的蛋白做調整),6000g,10分鐘,4℃離心收集細菌,去盡上清,將菌體至于-20℃放置O/N
4) 室溫凍融菌體,馬上置于冰上,每500ml培養液加入10-20ml細菌裂解液(PBS 1%Triton-100 PMSF),吹打混勻
5) 冰上超聲破碎,開2秒,停9秒,總40-60分鐘。至裂解液充分清涼
6) 11000rpm,15分鐘,4℃離心分離上清, -80℃保存備用
2. 真核融合蛋白B的獲得
1) 將編碼B蛋白的堿基序列克隆到編碼標簽蛋白(如HA,或者myc)的真核表達載體上,進行細胞轉染
3. 48小時后,取適量融合蛋白GST-A冰上凍融
4. 取50-70ulGST-Beads(Immobilized Glutathione)到EP管中,用800ul PBS 1%Triton-100潤洗一次,將凍融融合蛋白GST-A與之混勻,4℃層析柜旋轉結合1小時。
5. PBS 1%Triton-100洗3次,PBS洗3次。留取20ul( PBS Beads)作Offer。
6. 同時,裂解真核融合蛋白B,去盡培養基,用PBS(RT)洗一次,加入300ul裂解液(以6well為例,PBS 1%Triton-100 Cocktaier),4℃放置30分鐘。
7. 吹打收集至1.5mlEP管,超聲破碎。13000rpm,15分鐘,4℃離心取上清。
8. BCA蛋白定量(optional)留取20ul做Offer,其余樣品加入到已純化蛋白的EP管中,用PBS補足液體到600ul左右,以便蛋白之間能充分結合!4℃旋轉結合O/N
9. PBS 1%Triton-100洗3次,PBS洗3次。
10. 40ul 5×loading buffer溶解beads上的蛋白,煮沸3分鐘,高速離心,Run –SDS PAGE做Western Blot檢測。用HA或者myc Blot。