大多數宮頸癌是由HPV感染所致。目前已分離出的HPV達100多型，其中至少14型可導致宮頸癌或其他惡性腫瘤。
全球范圍內，大多數的宮頸癌中可測出高危型HPVl6和18亞型，其中HPV16亞型誘發癌變的潛力最大。低危型HPV6和11亞型則與絕大多數生殖器尖銳濕疣和幾乎所有復發性呼吸道乳頭狀瘤相關。盡管外陰、陰道、陰莖和肛門的癌癥和癌前期病變相對罕見，但至少80%肛門癌和至少40%～60%外陰癌、陰道癌和陰莖癌是由HPV誘發的。
HPV基因型的分布因地理區域而不同，但在所有區域中占主導地位的致癌基因型均為HPV16亞型。