進行血清學檢測應注意如下問題：
1. 建議對所有懷疑有 HSV 感染的孕婦使用直接檢測病毒的方法（I-A）。但是，對有復發感染史或非典型生殖道疾病史者直接檢測病毒方法結果可以為陰性（Ⅲ，B）。
2.HSV-2 抗體可診斷生殖器皰疹;HSV-1 抗體不能區分是生殖道還是口咽感染。
3.HSV-2 型 IgG 陰性，HSV-1 型 IgG 陽性，應考慮是一種不常見的復發性生殖道感染。
4. 首發生殖器皰疹，應區分初次感染和既往感染（Ⅲ，B）。癥狀出現時，由于還沒有產生針對該病毒的 HSV 的 IgG（與生殖器病變檢測到的類型是一致的），應在隨訪時找到原發性感染的血清轉換的證據。
5. 初次感染型特異性 HSV 抗體可在癥狀出現 2 周 -3 個月后檢測到。凡有臨床癥狀，應隨訪取樣測定證實血清學轉換（IIa-B）。
6. 由于早期感染患者缺乏 IgG 抗體，所以檢測單純皰疹病毒 IgM 抗體能提高早期感染檢出率（Ⅱb-B）。但是由于 HSVIgM 在復發感染時可以出現陽性，在初次感染時可能出現陰性，它是非病毒型特異抗體。
7. 目前尚無 FDA 認可的 HSVIgM 分型試劑盒，而用于鑒別急性 HSV 感染的真正可信的分型檢測方法應為 PCR 技術的分子生物學方法。