IFN治療的絕對禁忌證包括：妊娠、精神病史（如嚴重抑郁癥）、未能控制的癲癇、未戒掉的酗酒或吸毒者、未經控制的自身免疫性疾病、失代償期肝硬化、有癥狀的心臟病。
IFN治療的相對禁忌證包括：甲狀腺疾病、視網膜病、銀屑病、既往抑郁癥史，未控制的糖尿病、高血壓，治療前中性粒細胞計數﹤1.0×109/L和（或）血小板計數﹤50×109/L ，總膽紅素﹥51μmol/L（特別是以間接膽紅素為主者）。
