通常根據目標化合物的溶解性和與LCMS中使用的各種電離技術的兼容性選擇溶劑。在ESI和其它常壓電離技術中,溶劑的揮發性和結合質子的能力很重要。
使用的主要質子溶劑像甲醇與水的混合物,比如1:1的甲醇水,或1:1的乙腈水,甲醇水混合物粘度超過了水或甲醇,因為在混勻時候發生了放熱反應。當使用100%的水時,水相對低的蒸汽壓可能對靈敏度產生不利。通過添加揮發性有機溶劑,降低表面張力,能提高靈敏度。表面活性劑雖然能增加從噴霧液滴中釋放的離子,但因其較高的質子親和力,可能降低靈敏度。非質子助溶劑,像10% DMSO水溶液和異丙醇,對某些化合物,能提高溶解度。在確保被測物比溶劑更偏堿性的前提下,甲酸通常以較低的水平(0.1%)添加到溶劑中,以便于電離。一些酸,即使是很少量,例如TFA,也可能限制靈敏度,但對增加一些化合物的溶解度可能是必需的。
在ESI電離模式中,緩沖液和鹽(Na+,K+和磷酸鹽)可降低蒸汽壓,導致信號減弱。可以通過使用相對較易揮發的緩沖液,例如由弱酸堿對形成的乙酸銨,來彌補液滴表面張力的增加以及由此導致的揮發性降低。