M13絲狀噬菌體一直是最流行的選擇,廣泛用于各種類型的研究。病毒外殼由五個不同的衣殼蛋白組成,包括一個主要衣殼pVIII(2,700拷貝)和四個次要衣殼(一端是pIII和pVI,另一端是pVII和pIX)。
與T4和T7不同的是,M13是溶原性噬菌體,它在周質中組裝,在不裂解宿主的情況下從細菌膜中分泌出來。M13噬菌體上的多重衣殼蛋白為具有獨特特性的多種肽和蛋白質提供了全面的展示選擇。這五種衣殼都已成功地用于具有獨特載體的外域顯示。PIII和PVIII是M13噬菌體展示的首要選擇。
噬菌體T4在許多方面不同于M13,T4具有更大的尺寸,尾部結構和編碼50種不同蛋白質的雙鏈DNA(dsDNA)基因組,較大的基因組DNA允許更大的外來蛋白的插入。可以在HOC和SOC上顯示兩個不同的結構域,這兩種非必需的外殼蛋白。可以使用N-和C-末端插入。在沒有膜分泌過程的情況下,使用T4噬菌體可以避免宿主毒性。
與絲狀噬菌體和λ噬菌體相比,T7噬菌體的生命周期較短。子代噬菌體的組裝在細菌細胞質中,通過細胞膜裂解而釋放,因此沒有大小限制和分泌過程導致的宿主毒性。此外,T7噬菌體在其他噬菌體不能存活的極端條件下非常穩定。
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