已有的研究結果顯示，Machado-Joseph病基因（MJDl）定位于染色體14q32.1區，該基因第3外顯子靠近3端的一段是不穩定CAG重復序列（C：胞嘧啶；A：腺嘌呤；G：鳥嘌呤），編碼MJDl基因產物ataxin-3，即多聚谷氨酰胺鏈，ataxin-3的正常功能尚不清楚，其發生擴展突變導致Machado-Joseph病，其CAG拷貝數是60～84（正常CAG拷貝數是14～47），其編碼的多聚谷氨酰胺鏈可能是本病發病的蛋白質基礎，對神經系統有毒性作用。
