疫苗根據工藝分為減毒疫苗，滅活疫苗，亞單位疫苗，基因工程疫苗，涉及一系方法進行質量控制，其中等電點及電荷變異體對于鑒別和工藝穩定性至關重要。本文涉及病毒，重組疫苗，mRNA疫苗，病毒樣顆粒（VLP)等不同類別疫苗的等電點及電荷異質性檢測。
1.新型人乳頭瘤病毒（HPV）治療性疫苗等電點測定
上海澤潤生物技術有限公司質量研究部，利用iCIEF，對新型人乳頭瘤病毒（HPV）治療性疫苗HPV16E7-HBcAg-Hsp65融合蛋白的等電點，進行圖譜鑒定。
Characterization and evaluation of the
immune responses elicited by a novel human papIllomavirus (HPV)
therapeutic vaccine: HPV16E7-HBcAg-Hsp65 fusion protein, J Virol Methods, 197, 1-6 Mar 2014.
2.活體脊髓灰質炎病毒等電點檢測
荷蘭轉化疫苗研究所利用iCIEF，觀察不同批次，以及不同儲存形式的1型PV（polio vaccine） Mahoney菌株培養的活體脊髓灰質炎病毒等電點的分析。從而判斷不同批次間病毒的pI測定的可重復性以及凍存對病毒pI值的影響。結果顯示，利用iCIEF觀察到，不同批次A-D之間的pI峰型是可比較的。且新鮮樣品A與存儲在-80°C的批次B-D，在對病毒pI峰型上沒有影響。
利用iCIEF，觀察不同菌株培養的脊髓灰質炎病毒pI峰型圖。為后續工藝開發，建立不同脊髓灰質炎病毒種類的pI表征圖。
Isoelectric point determination of live polioviruses by capIllary isoelectric focusing with whole column imaging detection,Anal Chem, 85 (12), 6089-94 2013 Jun 18.
3. 諾如病毒病毒樣顆粒等電點分析
加拿大圭爾夫大學食品安全研究所利用iCIEF，觀察6個不同種類的諾如病毒病毒樣顆粒（norovirus virus-like particles, VLPs）的pI峰型圖。可以觀察到每個VLP都有一個主峰（用于確定pI）和幾個小峰。后續研究發現，不同顆粒大小的VLP可以呈現不同的pI值。由于顆粒的不穩定，可以降解形成不同分子量的切割產物，因此構成峰形圖中的小峰。
利用iCIEF觀察諾如病毒病毒樣顆粒的pI峰重現性。結果顯示，利用iCIEF檢測到諾如病毒病毒樣顆粒的pI峰重現性很好。
Isoelectric Point Determination of Norovirus Virus-Like Particles by
CapIllary Isoelectric Focusing With Whole Column Imaging Detection, Anal Chem, 76 (1), 48-52 2004 Jan 1.
4. 脂質納米顆粒疫苗表面電荷表征
脂質納米顆粒（LNP）除了用于小分子，siRNA，mRNA和pDNA的藥物遞送，還被用于治療和疫苗的研發。