Nature公布最新HIV研究發現

　　來自Los Alamos國家實驗室的研究人員追蹤分析了流行病學意義上艾滋病患者HIV病毒擴散，以及系統發育學意義上病毒實際的快速進化之間的復雜關聯，由此研發出了一種新穎的方式，用于解析HIV病毒的擴散與演化。這一研究成果公布在11月19日的Nature雜志上。

　　文章的第一作者Thomas Leitner表示，“我們研發出了一種能用于估計疫情動態的新方法，從中我們可以了解是誰感染了誰，以及真正的人口感染發生率與單純的診斷日期。很顯然這些十分重要，尤其是對于公共衛生監控，決策和干預疫情，以及進一步的取證調查。 ”

　　研究人員采用傳統的計算機差分方程(differential equations)對未感染人群進行了模型分析，因為基于agent中介的組件分析較為苛刻，因此這種方法有助于提高速度。一旦某個人被感染，那么他/她就可以作為一個“中介”用于計算機建模，模型就開始追蹤他們的行為，以及艾滋病病毒的進化。

　　基于中介的建模

　　這種新的建模方法能區分易感個體與感染個體，從而捕獲整個感染史。未感染個體基于一個人口水平進行建模，并通過傳播風險和社會團體分層。在這個模型中形成社會網絡——模擬過程中可變。因此，該模型比傳統模型更加接近現實。

　　Leitner說， 流行病學模型的優勢在于“它使我們能夠利用人類交往的參數模擬流行疾病的

　　多種可能結果，其中社交網絡的形成是中介社交的一部分。這是一個靈活的系統，能用來描述現實人群中的變化。”

　　這個項目得到了美國NIH的資助，其相關項目“Reconstructing HIV Epidemics from HIV Phylogenetics”已發表論文10篇。

　　誰感染了誰

　　其中一個關鍵問題就是誰感染了誰，此前發表在另外一個刊物的研究成果，提出了一種新雜交系統，能用于模擬和分析艾滋病毒或其它病原體在人群中的傳播。

　　研究人員對Latvian HIV-1病毒進行了建模，他們發現注射吸毒者促進了異性人口中病毒的傳播，從而導致了整體疫情。研究人員目前正在擴大這種雜交模型，將其延伸到HIV遺傳進化領域中，分析它對每一個受感染個體的影響。

　　研究表明，在HIV快速流行過程中，比如個體之間自行注射藥物，HIV病毒的進化是緩慢的，出現的人群水平多元化很小。而且較慢的病毒擴散也顯示出在同等時間內更多艾滋病毒的演化。

　　新研究領域

　　了解HIV病毒的遺傳進化有助于研究人員通過病原體遺傳物質重構不同的流行病學場景，這一研究領域被稱為系統發育動態研究(phylodynamics，生物通譯)。

　　這項研究還開發了一種新的數學模型利用這種模型，研究人員能方便地通過之前用過的生物標記物(BED IgG)估計何時個體會感染了HIV病毒。

　　“這很重要，因為大多數HIV病毒感染者在感染后不久都沒有察覺到已經受到感染，他們往往在很久之后才發現，比如感染后幾年，”Leitner說，“因此需要估計真正的發病率，也就是實際發生感染的時間，而不是診斷日期。 ”