Nature子刊：基因外的DNA突變會引起癌癥

　　隨著對癌癥機理認識的不斷加深，我們已經找到了許多會導致癌癥的基因突變，為患者帶來了生命的希望。但在一個人的基因組里，只有2%的DNA是編碼蛋白質信息的“基因”。剩下98%的DNA對癌癥究竟有沒有作用，有怎樣的作用，至今依然沒有一個定論。

　　今日，加州大學圣地亞哥分校（UCSD）的研究人員在《自然》子刊《Nature Genetics》上刊發了一項最新研究。他們發現在非編碼DNA里，將近200個突變也在癌癥的發生中起到了作用。這一研究證實了基因外的DNA突變會引起癌癥，讓我們對癌癥的診療有了新的理解。

　　過去，我們對DNA突變致癌的理解相對還比較初級——基因里的突變會影響蛋白質的功能，異變的蛋白質會讓細胞變得異常，導致癌癥。現有的許多靶向療法，背后的機理就是針對這些異變的蛋白質。

　　那么，基因之外的突變，會對癌癥造成什么影響呢？研究人員們曾在15000個腫瘤樣本中尋找這一問題的答案，但只發現了一個可能與癌癥有關的突變。研究人員相信這是由于不同患者往往帶有大量不同的基因外突變，這極大干擾了他們的搜索結果，讓他們無法輕易找到突變與癌癥之間的聯系。

　　在這項研究里，科學家們做了多個改進。首先，他們從930名癌癥患者中同時分離出了腫瘤樣本和正常組織樣本，用于比對。其次，他們不僅分析基因外突變與腫瘤類型的關系，還分析了基因外突變與基因表達量的關系。這一下子就抓到了問題的關鍵。

　　“檢查基因表達量是我們成功的秘訣。”該研究的主要負責人之一Trey Ideker教授說道。

　　他們找到了193個非編碼區的突變。這些突變在腫瘤中非常常見，大部分突變與癌癥的關系能得到驗證。為了進一步確認這些突變的機理，研究人員們挑選了3個突變，進行后續的研究。他們在細胞中重現了這些突變，然后觀察這些細胞會發生怎樣的變化。

　　“舉例來說，我們找到了一個非編碼的突變，它能影響一個叫做DAAM1的基因，”該研究的共同第一作者Wei Zhang博士說道：“DAAM1的激活則會讓腫瘤細胞變得更有侵襲性，也能更好地侵入周圍的組織。”

　　換句話說，這些非編碼DNA的突變，也許能通過影響關鍵基因的表達，影響癌細胞的行為，推動癌癥進展。

　　“許多癌癥相關的突變都發生在非編碼區，但它們的數量太多了，很難找到哪些真正和癌癥相關，哪些只是噪音，” Ideker教授補充道：“在這個研究里，我們首次找到了近200個非編碼DNA中的突變，它們可能在癌癥中起作用。”

　　未來，研究人員們期待能將編碼區和非編碼區的突變結合起來看，尋找是否會在乳腺癌等特定的癌癥類型中出現一定的規律。如果有，那這將給諸多癌癥治療帶來全新的靶點，甚至是全新的療法。