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  • 發布時間:2018-09-07 16:20 原文鏈接: NatureMethods:科學家成功使用AI預測癌癥進化

      一個來自英國和美國的聯合研究團隊已經開發出了一種使用人工智能預測腫瘤可能如何改變以及如何在病人體內傳播的方法,相關研究成果于近日發表在《Nature Methods》上,題為“Detecting repeated cancer evolution from multi-region tumor sequencing data”。

      通過過去數十年的研究,科學家們已經發現腫瘤實際上在不斷進化,這使得它們可以改變它們的發生以及轉移的方式。而明白這個進化過程如何工作被認為是阻止癌癥發生的關鍵所在。為了揭示其中的秘密,研究人員已經收集了病人的腫瘤組織樣品,試圖找出它們改變的模式。但是這種方法被證明很難成功,因為當腫瘤生長時,它們也會出現新的突變,而這些突變對它們的轉移能力并無影響。

      在這項最新研究中,科學家們試圖引入機器學習來追蹤腫瘤轉移過程中發生的進化改變。研究人員將他們的新系統命名為“Revolver”。這個新系統使用機器學習算法來研究基因突變數據并檢測相關模式。研究人員給他們的系統輸入了來自178名癌癥病人的768個腫瘤的信息,每個病人都有乳腺癌、腎癌、腸癌或者肺癌。利用這些數據,這個系統成功地找到了病人間與促使腫瘤轉移的改變相關的突變模式。

      接下來,研究人員將這個系統學習獲得的知識用于新的病人以評估他們新發生的腫瘤的狀態,結果發現這個學習后的系統在95名直腸癌病人中成功地找到了基因突變,而這些基因突變在過去已經被發現是乳腺癌、腎癌和肺癌進化的驅使基因。

      研究人員表示Revolver僅僅是開發基于計算機的更好預測腫瘤進化方式的工具的第一步,這種工具將使得醫生更精確容易地為病人制定最佳治療方案,從而改善他們的預后。


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