在一項新的研究中,美國研究人員發現一種稱為BORIS的蛋白是某些兒童癌癥的罪魁禍首。這種蛋白能夠破解神經母細胞瘤基因組,導致在某些類型的治療后處于休眠狀態的癌細胞蘇醒過來,從而引起癌癥復發。他們還發現這種蛋白與其他幾種癌癥中的耐藥性相關。相關研究結果近期發表在Nature期刊上,論文標題為“BORIS promotes chromatin regulatory interactions in treatment-resistant cancer cells”。論文通信作者為達納-法伯癌癥研究所/波士頓兒童醫院的Rani George博士。

圖片來自Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1472-0。
產生耐藥性
當細胞需要開啟特定基因時,包裹我們DNA的長長的染色質纖維會形成環狀結構。這些染色質環狀結構讓基因啟動子和基因增強子靠得很近,從而使得一個基因或一組基因得以開啟和表達。這項研究發現,在神經母細胞瘤中,BORIS形成并錨定了新的環狀結構,同時開啟了許多基因,但不是以一種好的方式。
George說,“它調節著耐藥性神經母細胞瘤細胞存活的基因的表達。”
兒童癌癥可能特別容易受到BORIS作用的影響。與成人癌癥不同的是,它們很少是由DNA突變引起的。相反,它們通常是由于表觀遺傳影響而產生的,包括改變染色質環狀結構并對重要基因的表達進行修飾的因素。表觀遺傳因素也有助于耐藥性的產生。
探究神經母細胞瘤耐藥性
George和他的同事們開始用抑制基因ALK發生的一種已知的可靶向突變的藥物處理人類神經母細胞瘤細胞,直到這些癌細胞對ALK抑制劑產生耐藥性為止。這些耐藥性癌細胞具有增加的癌基因MYCN拷貝。作為一種癌基因,MYCN有助于驅動神經母細胞瘤、預示預后不良,但是它是不能直接靶向的。
為了更好地理解這種耐藥性的產生,這些研究人員隨后對藥物敏感的、部分耐藥性和完全耐藥性的神經母細胞瘤細胞進行了單細胞RNA測序,以查看每種細胞狀態下哪些基因開啟和關閉。
他們發現當用ALK抑制劑處理這些癌細胞時,有一些癌細胞退化到一種更為原始的狀態,表達了許多自我更新因子。在這種狀態下保持休眠一段時間后,它們開始蘇醒和增殖。這正是BORIS出現的時候。
發現BORIS
RNA測序表明從休眠狀態蘇醒并又開始增殖的癌細胞正在產生大量的BORIS。這些癌細胞仍然攜帶ALK突變,并具有增加的MYCN癌基因拷貝。但是,這種癌癥不再需要這些來生長。
George說:“這些癌細胞已經進化出完全不同的表型。它們與原始的神經母細胞瘤細胞完全不同。突變的ALK基因在蛋白水平上不表達,而且即使這些癌細胞中有50到100個MYCN癌基因拷貝,但是它們也不表達。”
相反,在BORIS的驅動下,這些癌細胞表達了許多通常在早期神經組織中觀察到的因子。
George說,“我們發現神經母細胞瘤中BORIS的過度表達與患者預后不良有關。”
這些研究人員繼續研究其他癌癥中的基因表達。在尤文肉瘤、膠質母細胞瘤、非小細胞肺癌、乳腺癌和卵巢癌中,復發性的耐藥癌癥中的BORIS表達高于低風險的癌癥。
George和她的同事們如今開始尋找靶向BORIS的方法。這項研究提供了線索:鑒于一種稱為BRD4的蛋白與BORIS一起促進基因表達,抑制BRD4蛋白可以抑制表達BORIS的神經母細胞瘤生長,而且這種抑制程度要大于不表達BORIS的神經母細胞瘤。
好比偵探案件
乍看之下,BORIS似乎并不是一種可能的癌癥靶標。在正常情形下,它僅在胚胎發育過程中表達,隨后僅在睪丸和卵巢細胞中發現。但是,在越來越多的研究中,它突然出現了,從而引發了有關它發揮什么作用的問題。
George說:“我們發現了BORIS的一種以前未知的作用。”她是偵探小說的狂熱讀者,她將自己團隊的研究比作法醫調查。她說:“你從未懷疑的人可能就是罪魁禍首。那么,你的責任就是向由你的同行組成的科學‘陪審團’證實你的觀點。”
盡管染色質環狀結構的形成是出乎意料之外的,但是這項研究提供了新的線索,這些線索可能會在未來帶來豐厚的回報。(生物谷 Bioon.com)
參考資料:
1.David N. Debruyne et al. BORIS promotes chromatin regulatory interactions in treatment-resistant cancer cells. Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1472-0.
2.Meet BORIS: Possible new culprit in drug-resistant cancer
https://medicalxpress.com/news/2019-09-boris-culprit-drug-resistant-cancer.html
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