一、PCR擴增體系
1. 1.0uM 引物
2. 300ng待測樣本基因組DNA
3. 2.0U Taq多聚酶
4. 200uM 各種dNTP
5. 用1 X PCR緩沖液(10mM Tris-HCl,pH8.3,50mM KCl,1.5mM MgCl2,0.01%明膠)調至總體積100ul,并用50ul礦物油覆蓋,防止水分蒸發。
二、PCR擴增程序
按下列條件擴增30個循環,此程序適用于Perkin-Elmer9600擴增儀,其他型號擴增儀也可以參考。
1. 檢測DR3、5、6、8
預變性:94℃,5分鐘
變性: 94℃,30秒
退火: 60℃,50秒
延伸: 72,℃40秒
2. 檢測DR2
預變性:94℃,5分鐘
變性: 94℃,30秒
退火: 62℃,50秒
延伸: 72℃,40秒
3. 檢測DR1
預變性:94℃,5分鐘
變性: 94℃,30秒
退火: 55℃,50秒
延伸: 72℃,40秒
三、PCR擴增產物的鑒定
此步驟是監測PCR擴增的結果,預先用2%瓊脂糖和1 X TBE制備凝膠,每100ml凝膠中加入10ul溴化乙錠(10mg/ml),用梳子形成約10ul的加樣孔,讓凝膠完全凝固。
1. PCR擴增完畢后,吸取10ul的PCR反應液,置另一擴增管中;
2. 加入1~2ul的加樣緩沖液(4%蔗糖,0.05%溴酚藍);
3. 20V/cm電泳;
4. 溴酚藍移動7cm后停止電泳
5. 在紫外投射光下觀察電泳結果并拍照。
PCR擴增后,電泳凝膠上應出現相應的PCR擴增產物條帶。
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