最近,美國猶他大學的研究人員發明出一種方法,來觀察新形成的AIDS病毒顆粒從受感染的人類細胞顯露或“出芽”,而不會干擾這個過程。利用這種方法,研究人員發現,一種稱為ALIX的蛋白質介入了病毒復制的最后階段,而不是以前認為的較早階段。
相關研究結果發表在2014年5月16日的《公共科學圖書館期刊》(PLOS ONE),本文資深作者、物理與天文學助理教授、病毒學家Saveez Saffarian指出:“我們每次觀察一個細胞,使用數碼相機和特殊的顯微鏡,拍攝出芽過程中的視頻和照片。”
“我們第一次看到,ALIX被招募到HIV的出芽過程中。大家都知道ALIX參與HIV的出芽過程,但是沒有人能將ALIX到該過程的招募可視化。”
Saffarian稱,這一發現屬于基礎科學,對艾滋病患者沒有直接的臨床意義,因為ALIX參與了太多的重要功能(如細胞分裂),因此不能作為新藥物的一個可能靶標。
他補充說:“我們非常了解這些幫助HIV脫離細胞的蛋白,但是我們不知道它們是如何團結在一起幫助病毒脫離的,在未來的10到20年,我們將對這一機制有更多了解。它將會是一個藥物靶點嗎?將是用于以后治療或生物技術行業的生物化學的一部分么?現在我不能給出答案。但是如果不是因為我們的好奇心,就不會有今天的這項新技術。”
猶他大學醫學院生物化學系主任、HIV出芽專家Wes Sundquist教授表示:“這項新研究工作非常的出色,對于我們這些研究HIV組裝機制的人來說,這是真正的興趣。”
這項工作是由美國國家科學基金會資助。第一作者為猶他大學物理學博士Pei-I Ku,共同作者還包括:物理學和天文學博士后Mourad Bendjennat、技術員Jeff Ballew和博士后Michael Landesman。
觀察HIV出芽
多年來,研究人員利用生化方法,包括在實驗室玻璃器皿中收集上百萬種病毒,進行不同的分析,揭示構成病毒的蛋白質,例如利用結合到某些蛋白質上的抗體,以及使第一個蛋白發出熒光的其他蛋白質。
Saffarian稱:“你不能同時在一種病毒內進行這些分析。因為你沒有看到相似病毒之間的差異。你沒有看到各種蛋白質來來往往幫助病毒脫離細胞的時機。”
其他一些方法,當HIV顆粒在細胞上出現時,將其冷凍或固定在細胞上,并用電子顯微鏡拍攝這些病毒復制的定格圖像。Saffarian也使用稱為“全內反射熒光顯微鏡”的技術,這種技術已被用來觀察細胞中的動態過程。
以前,有研究人員使用這種方法,實現了HIV和一種相似的馬病毒(EIAV)的出芽成像。但是,Saffarian稱,他們的研究并沒有表明ALIX參與HIV出芽,并且有缺陷,因為它們錯誤地指出,ALIX蛋白介入EIAV出芽過程的較早階段,在HIV出芽過程中也同樣。
Ku、Saffarian及其同事將這種顯微鏡技術與改進的方法結合,在克隆細胞中,通過遺傳學手段將一種綠色熒光標簽結合到ALIX蛋白,因此他們可以看到蛋白質,而無需傷害其正常的結構。研究人員嘗試了許多所謂的“接頭序列(linker)”,找到了一個接頭序列可使他們看到介入HIV出芽的 ALIX蛋白,而不會干擾這個過程。
他補充道,無論是顯微鏡技術,還是綠色熒光標記蛋白都不是新的,但是這項研究的創新之處在于,使用了許多不同種類的連接序列,將這些熒光蛋白結合到ALIX,以找到可讓ALIX蛋白正常運轉的那一個連接序列。
Saffarian稱,早期研究表明ALIX蛋白介入出芽過程的早期階段,但問題是,這些研究只使用了一個連接序列,從而削弱了ALIX的正常功能。
觀察蛋白質形成HIV
當HIV在人類細胞內復制時,一個稱為Gag的蛋白構成其大部分新顆粒——每個HIV顆粒中有4000個Gag蛋白拷貝,雖然其他一組蛋白也參與了這個過程,包括ALIX,這代表“alg-2互作蛋白x”。Saffarian研究小組所使用的病毒樣顆粒,是被剝奪基因藍圖或基因組的HIV顆粒,所以它們在實驗室不會造成感染風險。并且,病毒樣顆粒能夠保持與傳染性HIV相同的幾何形狀和萌芽過程。
在病毒出芽期間,Gag蛋白在細胞膜里面組裝——在后期階段與ALIX一起,形成一個新的HIV顆粒并使其脫離細胞,艾滋病患者中的AIDS可通過這個過程,從一個細胞傳播到另一個細胞。
為了觀察出芽過程,Ku、Saffarian和同事們把包含病毒顆粒的人HELA細胞放入培養皿的少量液體培養基中,將其放置在顯微鏡下,這是一個保持在體溫狀態的玻璃室,因此細胞能夠存活超過48小時。一束固態藍色激光瞄準樣品,使綠色標記的ALIX蛋白和紅色標簽Gag蛋白發光或發熒光,以便于它們組裝成病毒顆粒時可被觀察到。
Saffarian指出:“利用紅色標記的Gag蛋白和綠色標簽的ALIX蛋白質,我們能夠看到ALIX出現在病毒顆粒組裝的后期,大約100個 ALIX蛋白質與大約4000個Gag分子融合,并組裝成一個新的HIV顆粒。然后,ALIX引進兩種其他蛋白質,它們可在出芽病毒顆粒浮現時,將其從細胞上切斷。在這之前,還沒有人確定ALIX在新病毒顆粒擠壓斷離期間所處的位置。”
研究人員每次觀察來自一個細胞的病毒顆粒出芽:通常其中有100個在兩小時內出現。Saffarian稱,大多數ALIX蛋白質在HIV組裝完成后離開,并返回到細胞內液中。
他認為,ALIX直到HIV出芽的晚期階段才參與其中,這說明病毒中存在一種以前未被確認的機制,這一機制可調節ALIX和其它蛋白在組裝新HIV顆粒過程中的時機。
Saffarian指出:“我們發現,幫助病毒釋放的細胞成分,實際上到達的時間要以比基于生化數據預測的更為復雜。這項研究結果非常有前景,因為它揭示了細胞成分招募到HIV出芽部位的一種新調控機制,并為未來HIV出芽機制的研究打開了大門。”
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