1.RNAi：（RNA interference）RNA干擾
一些小的雙鏈RNA可以高效、特異的阻斷體內特定基因表達，促使mRNA降解，誘使細胞表現出特定基因缺失的表型，稱為RNA干擾（RNA interference，RNAi，也譯作RNA干預或者干涉）。它也是體內抵御外在感染的一種重要保護機制。
2.siRNA： (small interfering RNAs)小干擾RNA
一種短片斷雙鏈RNA分子，能夠以同源互補序列的mRNA為靶目標降解特定的mRNA，這個過程就是RNA干擾途徑（RNA interference pathway）。
3.shRNAs:(RNA-Short hairpin
RNAs)短發夾RNA是設計為能夠形成發夾結構的非編碼小RNA分子，短發夾RNA能夠通過RNA干擾來抑制基因的表達。Thomas
Rosenquist's group和Greg Hannon's
group聯合研究了在哺乳動物種系細胞中shRNAs的轉移導致基因長時間穩定沉默的機制。4.bp:(Base
Pair)堿基對兩個堿基（A和T，或者C和G）之間靠氫鍵結合在一起，形成一個堿基對。DNA的兩條鏈就是靠堿基對之間的氫鍵連接在一起，形成雙螺旋結構。
5.Base sequence:堿基序列DNA分子中堿基的排列順序。6.Base Sequence Analysis:堿基序列分析分析出DNA分子中堿基序列的方法（這種方法有時能夠全自動化）
cDNA：參見互補DNA。
7.cDNA：互補DNA以信使RNA為模板合成的DNA，常常采用互補DNA的一條鏈作為繪制物理圖譜時的探針。
8.Complementary sequence：互補序列以一條核苷酸鏈為模板，根據堿基互補規則形成的互補鏈，稱為該模板的互補序列。9.Genomic Library：基因組文庫對某個染色體，制備隨機產生的、相互之間有重疊部分的片段的克隆。
10.RISC：（RNA-induced silencing complex）RNA誘導沉默復合物
在
RNAi效應階段，siRNA雙鏈結合一個核酶復合物從而形成所謂RNA誘導沉默復合物。激活RISC需要一個ATP依賴的將siRNA解雙鏈的過程。激活的RISC通過堿基配對定位到同源mRNA轉錄本上，并在距離siRNA3'端12個堿基的位置切割mRNA(3,
18, 27, 29)。盡管切割的精確機制現在還是未知，研究表明每個RISC都包含一個siRNA和一個不同于Dicer的RNA酶。
11.Dicer：Dicer酶
RNaseIII家族中特異識別雙鏈RNA的一員，能以一種 ATP依賴的方式逐步（processive）切割由外源導入或者由轉基因、病毒感染等各種方式引入的雙鏈RNA，切割將RNA降解為19—21bp的雙鏈RNAs(siRNAs)，每個片斷的3'端都有2個堿基突出(27, 28)。
12.PTGS：(Post-transcriptional Gene Silencing ,PTGS)轉錄后基因沉默部分的植物中的基因沉默是在轉錄后發生的。它是相對于部分植物中發生的轉錄階段的基因沉默（TGS）而言的。13. TGS：（transcriptional gene silencing）轉錄階段基因沉默
14.gene silence:基因沉默
研究結果發現有大量的轉基因植株不能正常表達，通常這并不是由于轉基因的缺失或突變引起的，而是基因失活的結果.這種失活的現象稱為基因沉默。
15.RNA transfection：RNA轉染。
16.Sense RNA：正義鏈RNA
17.Antisense RNA：反義鏈RNA。
18.19+2+2 nt siRNA：
在細胞中雙鏈RNA一般都被切割成21-23小片段，這樣的RNA片段能達到更好的RNAi作用。人工合成的siRNA也是依據這個原理，所合成的RNA就是19nt的堿基序列再加上兩端的識別序列如 -GG，-TT等。19.SECs:(siRNA expression cassettes)siRNA表達框架一種由PCR得到的siRNA表達模版，能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。20.Homologies：同源性指同種類不同個體或者不同種類個體之間的，染色體或者蛋白質序列的相似性