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  • 發布時間:2019-08-02 22:57 原文鏈接: RNAi表達載體構建

    近年來的研究表明,一些短片斷的雙鏈RNA可以通過促使特定基因的mRNA降解來高效、特異的阻斷體內特定基因表達,誘使細胞表現出特定基因缺失的表型, 稱為RNA干擾(RNA interference,RNAi)。siRNA(small interfering RNAs)就是這種短片斷雙鏈RNA分子,能夠以序列同源互補的mRNA為靶目標,降解特定的mRNA。RNAi的發現具有劃時代的意義,它不僅深入揭示 了細胞內基因沉默的機制,而且它還是后基因組時代基因功能分析的有力工具,極大地促進了人類揭示生命奧秘的進程。現在越來越多的研究人員開始采用RNAi 來研究生物體的基因表達。RNAi技術可廣泛應用到包括功能基因組學,藥物靶點篩選,細胞信號傳導通路分析,疾病治療等等。

    目前為止較為常用的5種制備siRNAs的方法包括

    ·         化學合成 

    ·         體外轉錄 

    ·         長片斷dsRNAs經RNase III 類降解 (e.g. Dicer, E. coli, RNase III)

    ·         siRNA表達載體或者病毒載體在細胞中表達siRNAs

    ·         PCR制備的siRNA表達框在細胞中表達

    五種方法優缺點比較如下:

  •  比較項目

    化學合成

    體外轉錄

    RNase III降解dsRNA

    siRNA
    表達載體

    PCR
    表達框

    材料需求

     21-mer RNA
    oligos(
    一對)

    29-mer DNA oligos(一對)

    轉錄模版 (200-1000bp,兩側帶T7 啟動子)

    55-60-mer DNA oligos(一對)

     ~50-mer DNA oligos(一對)

    全部制備/合成時間所需時間

    4天—2周

    24 小時 + DNA oligo合成時間

    1 天 + 轉錄模版制備時間

    5天以上 + DNA oligo合成時間

    ~ 6 小時 + DNA oligo合成時間

    個人所需操作時間

    幾乎不需要*

    中等

    中等

    多

    中等

    是否需要驗證和尋找最有效siRNA

    需要

    需要

    不需要

    需要

    需要

    能否標記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進入細胞過程或者在細胞中的定位)

    能

    能

    能

    不能

    不能

    轉染的相對難易程度

    好

    好

    好

    差

    差

    可篩選性 (例如抗生素篩選)

     不可以

    不可以

    不可以

    可以

    不可以

    能否用于長效抑制

    不可以

    不可以

    不可以

    可以(抗生素篩選)

    不可以

    能否大規模制備

    可以

    有限

    有限

    可以

    有限

    檢測總體轉染效率

    不可以

    不可以

    不可以

    可以

    不可以

    每個基因的相對費用(不包含人力)

    高

    中等

    低

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