八、PCR產物電泳
先將1-10μl左右PCR產物,加已點在紙上的溴酸蘭,反復吸打混勻后進行電泳,一般電流為10mA,電源100V,電泳30分鐘,紫外燈下觀察,滿意的結果掃描打印。
九、幾個注意點:
1、逆轉錄的關鍵步驟是立即冰水浴?
2、Rt時,先打開PCR預熱30分鐘。
3、RNA抽提前,打開離心機預冷。
TRIzol法抽提總RNA
細胞1×107
組織100mg
↓
加1mlTRIzol
細胞用1ml加樣器吹至液體澄清且無細胞團塊
↓
勻漿(要徹底,后轉至EP管)
(組織勻漿量>100mg時分裝1ml/每EP管)
↓
顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓
加氯仿1/5體積(0.2ml)(必須按總體積的1/5)
↓
顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓
4℃,離心12000g,15分鐘
↓
轉上層水相(約400μl)于另一1.5mlEP管中
↓
加等體積異丙醇(約400μl),混勻室溫10分鐘
↓
4℃,離心12000g,10分鐘
↓
棄上清
↓
加冰預冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml
↓
4℃離心7500g,5分鐘
↓
棄上清,空氣干燥5-10分鐘(不能完全干燥)
↓
溶于DEPC水中至20μl(10μl-20μl)
(可在55-60℃水中,<10分鐘助溶)
注:
1、RNA若用于核酸轉移應溶解于樣本緩沖液中,否則DEPC溶解
2、細胞組織加TRIzol勻漿后,可在-60℃放置至少一個月(甚至可一年以上)
3、RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年
兩步法RT-PCR
(第一步:逆轉錄反應)
試劑 濃度 體積 終濃度
RNA 23μl(11.5μl)
Oligo(dT)15 0.05μg/μl 4μl(2μl) 0.005μg/μl
(稀釋10倍后用)
↓
混勻,離心,70℃ 5min
↓
立即冰水浴,稍離心
↓
試劑 濃度 體積 終濃度
M-MLV Buffer 5× 8μl (4μl) 1×
dNTP 10mM 2μl (1μl) 0.5mM
RNasin 40U/μl 1μl (0.5μl) 20μ
M-MLV 200U/μl 2μl (1μl) 200U
總體積40μl(20μl)
↓
混勻,離心,42℃ 60min
↓
95℃ 10min(破壞MLV)
↓
4℃保存
兩步法RT-PCR
(第二步:PCR反應)
總體積20μl(50μl)
試劑 濃度 體積 終濃度
Taq Buffer 10× 2μl (5μl_) 1×
MgCl2 25mM 1.2μl (3μl) 1.5mM
dNTP 10mM 0.2μl (0.5μl) <200uM
上游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol
下游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol
cDNA模板 X (?) (1-10μl)
DEPC水 20μl-4.3μl-X