• <table id="4yyaw"><kbd id="4yyaw"></kbd></table>
  • <td id="4yyaw"></td>
  • 發布時間:2019-11-03 18:13 原文鏈接: RTPCR實驗步驟

    實驗材料:水稻葉片的 RNA 。

    實驗原理:目前 PCR 技術只能擴增 DNA 模板,對 RNA 模板不能直接擴增。mRNA反轉錄生成的 cDNA 可作為 PCR 的模板進行擴增,這種在 mRNA 反轉錄后進行的 PCR 擴增稱為 RT-PCR 。 RT-PCR 比 Northern 雜交更靈敏,對 RNA 的質量要求較低,操作簡便,它是在轉錄水平上檢測基因時空表達的常用方法。本實驗以水稻葉片 RNA 為材料,檢測β -actin 基因的表達。實驗中設定2 個陰性對照:一個不加模板 RNA ,另一個不加反轉錄酶,主要是消除 DNA 及PCR 試劑方面引起的假陽性;同時以葉片 DNA 為陽性對照,檢驗 PCR 試劑和擴增過程是否有問題。

    實驗步驟:

    RNA 抽提

    1. 用TRIzol 試劑提取植物總RNA。

    2. 將總RNA 稀釋到終濃度1μg/μl 。

    3. 在0.5 ml 的無菌eppendorf 管中分別加入:

    Total RNA 0.5- 1 μ g

    RNase-free DNase I 1 μ l ( 1 u / μ l)

    10 × DNase I buffer 1 μ l

    DEPC 處理的ddH2O 5 μ l

    4. 37 ℃ 保溫15 min, 然后70 ℃ 保溫10 min. 。

    反轉錄反應

    1. 加1μl 500 μ g / ml oligo (dT)15 primer, 渦旋混合,簡單離心。

    2.在65 ℃加熱混合物10 分鐘, 然后室溫10 分鐘,再分別加入下列試劑:5 × 第一鏈緩沖液4μl、0.1 M DTT 2μl、

    10 m M dNTP 1μl

    3.渦旋混合后,簡單離心,37℃水浴2 min.。

    4. 加2μl 200 U / ml 的M-MLV 反轉錄酶。輕緩混合,37℃保溫1h。其總體積應為20μl。

    5. 70 ℃加熱15 min 終止反應,然后加20μl 的ddH2O ,cDNA 第一鏈可作為模板用于PCR 擴增。

    6. 若要去除與cDNA 互補的RNA,可加1μl (2 units)的RNase H,然后37 ℃保溫20 min。

    PCR 擴增

    1. 在冰上混合加入下列試劑:

    cDNA 第一鏈 1μl

    TaKaRa Ex Taq (5u/1μl) 0.5μl

    10 × Ex Taq buffer 5μl

    dNTP mixture (2mM) 4μl

    Primer F (10 mM) 2μl

    Primer R (10 mM) 2μl

    ddH2O 35.5μl

    2. PCR 反應程序

    Step 1 94℃ 3min 1

    Step 2 94℃ 1min, 60℃ 1min, 72℃ 1min, 30-40 Cycles

    Step 3 72℃ 5 min 1

    Step 4 4℃ forever

    3. 以β-actin 作為每個RT-PCR 的內在標準,以水代替反轉錄酶來檢測RT-PCR中的DNA 污染。

    所使用試劑:

    5 × 第一鏈緩沖液 (GIBCO Part No.Y00146)

    100 mM DTT (GIBCO Part No.Y11147)

    200 U/μl M-MLV Reverse transcriptase (GIBCO Part No.28025-021)

    500μg/ml oligo (dT) 15 primer (Promega Cat. No. C110A 9362612)

    10 mM dNTP 混合物

    RNase-free DNase I (TaKaRa Code No. 2215 CA)

    5U/μl Ex Taq polymerase 和10 × buffer (TaKaRa Code No. RR001D CA)

    10μM specific Primer F and R

    Sterile ddH2O


  • <table id="4yyaw"><kbd id="4yyaw"></kbd></table>
  • <td id="4yyaw"></td>
  • 调性视频