實驗中的一些好習慣
加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均
移液槍用完之后要歸到最大計量的位置,防止久而久之彈簧失去彈性
一定要記著關水浴箱,切記切記
多和大家討論,同時多關注別人討論的經驗,這幾乎是最快提高的捷徑了
所有的試劑都自己配,出了問題才好找原因
一、防止RNA酶污染的措施
1.所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。
2.塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。
3.有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室溫10min,然后用0.1% DEPC水沖洗,晾干。
4.配制的溶液應盡可能的用0.1% DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經0.22μm濾膜過濾除菌。
5.操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。
6.設置RNA操作專用實驗室,所有器械等應為專用。
二、常用的RNA酶抑制劑
1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環結合使蛋白質變性,從而抑制酶的活性。
2.異硫氰酸胍:目前被認為是最有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從核蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。
3.氧釩核糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,它和RNA酶結合形成過渡態類物質,幾乎能完全抑制RNA酶的活性。
4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,可以和多種RNA酶結合,使其失活。
5.其它:SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。
因為DEPc不加選擇的修飾蛋白質和RNA,因此在分離和純化RNA過程中不能使用,而且它與一些緩沖液(例如Tri)不能相容
在所有RNA實驗中,最關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。
RNA酶可耐受多種處理而不被滅活,如煮沸、高壓滅菌等。
研究人員造成的污染 RNA酶最主要的潛在污染源是研究人員的手。因此進行RNA實驗時應勤換手套。
但DEPC能與胺和巰基反應,因而 含Tris和DTT的試劑不能用DEPC處理
(一)動植物總RNA提取-Trizol法
Trizol法適用于人類、動物、植物、微生物的組織或培養細菌,樣品量從幾十毫克至幾克。用Trizol法提取的總RNA絕無蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑點分析,斑點雜交,Poly(A)分離,體外翻譯,RNase封阻分析和分子克隆。
1、將組織在液N中磨成粉末后,再以50-100mg組織加入1ml Trizol液研磨,注意樣品總體積不能超過所用Trizol體積的10%。
2、研磨液室溫放置5分鐘,然后以每1mlTrizol液加入0.2ml的比例加入氯仿,蓋緊離心管,用手劇烈搖蕩離心管15秒。
3、取上層水相于一新的離心管,按每mlTrizol液加0.5ml異丙醇的比例加入異丙醇,室溫放置10分鐘,12000g離心10分鐘。
4、棄去上清液,按每ml Trizol液加入至少1ml的比例加入75%乙醇,渦旋混勻,4℃下7500g離心5分鐘。
5、小心棄去上清液,然后室溫或真空干燥5-10分鐘,注意不要干燥過分,否則會降低RNA的溶解度。然后將RNA溶于水中,必要時可55℃-60℃水溶 10分鐘。RNA可進行mRNA分離,或貯存于70%乙醇并保存于-70℃。