病理生理
已經觀察到腸道上皮細胞可被SARS-CoV侵染。有人認為SARS病人腹瀉的主要原因是早期以發熱為主的病毒血癥及繼之肺部炎性滲出、實變造成換氣障礙的低氧血癥，使胃腸道發生非特異性損害。鑒于目前的免疫發病機制學說，尚不能排除病毒通過直接或間接的免疫機制引發對胃腸道的損傷。明確的發病機制有待進一步研究。
胃、腸道、胃壁各層結構完整，胃、小腸和結腸各段黏膜下淋巴組織減少，淋巴細胞稀疏，間質水腫。部分病例胃可見表淺的糜爛或潰瘍。內鏡下結腸黏膜及回腸末段未見異常，尸檢標本在顯微鏡下亦見正常的組織結構，無微絨毛萎縮、炎癥、細菌感染、病毒包涵體或者肉芽腫。此外，除部分自溶變化外，大體眼觀及光鏡沒有異常。結腸黏膜及回腸末段在電鏡觀察到的病毒顆粒(60～90nm)與SARS-CoV吻合，病毒局限于上皮細胞。細胞內病毒顆粒可能包含在擴張的內質網中。微絨毛的表面可見病毒顆粒聚集。可能提示病毒自腸細胞表面離開。仍然沒有證據顯示絨毛萎縮。
診斷檢查
診斷：在確診SARS診斷的基礎上，患者出現不同程度的惡心、嘔吐、食欲減退、腹瀉，腹瀉每天10次以內，持續3～8天。大便多呈黃色稀水樣。不伴腹痛。即可確診SARS的胃腸道感染。
實驗室檢查：
1.大便常規多為黃色稀水樣，鏡檢有少許白細胞(1～6個/HP)，伴發消化道出血可見較多紅細胞。部分患者谷丙轉氨酶(ALT)輕度升高。糞便中RT-PCR可以檢出病毒。
2.血常規病程初期到中期白細胞計數通常正常或下降，淋巴細胞則常見減少，部分病例血小板亦減少。T細胞亞群中CD3+、CD4+及CD8+T細胞均顯著減少。疾病后期多能恢復正常。
其他輔助檢查：SARS影像學檢查絕大部分患者在起病早期即有胸部X線檢查異常，多呈斑片狀或網狀改變。起病初期常呈單灶病變，短期內病灶迅速增多，常累及雙肺或單肺多葉。部分患者進展迅速，呈大片狀陰影。雙肺周邊區域累及較為常見，而胸腔積液、空洞形成以及肺門淋巴結增大等表現則較少見。對于胸片無病變而臨床又懷疑為本病的患者，1～2天內要復查胸部X線檢查。胸部CT檢查以玻璃樣改變最多見。肺部陰影吸收、消散較慢；陰影改變與臨床癥狀體征有時可不一致。