1. SNP檢測方法分類
1.1. 根據檢測原理分類
根據檢測原理進行分類,目前來說,基于雜交原理的檢測方法應用更為廣泛。 1.2. 根據檢測通量分類 根據檢測通量進行分類,可以分為高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量總的基因芯片法(包括beadschip)應用更為廣泛。除此之外,基于Taqman方法,進行了具體技術的升級和設備耗材的替換,發明了ArrayTape法(基于Taqman原理,用塑料卷代替微孔板,用水浴鍋代替PCR儀)和OpenArray(基于Taqman原理用預置了PCR引物的微孔來代替微孔板)法。 2. SNP檢測方法對比 不同的檢測方法適用于不同的檢測場景,主要包括:消費級、臨床級和研發級。目前應用廣泛的是Thermo
Fisher的原位芯片和Illumina的磁珠芯片。兩種芯片非別為23魔方和WeGene所用的主要檢測方法。目前檢測價格已經下降至500元左右,并且23魔方已經把價格下降至299元。 3. 部分SNP的檢測流程 3.1. Taqman法 檢測周期:3-6周 檢測平臺:Roche LightCycher 480 檢測周期:4-8周 檢測平臺:ABI 3730XL 測序儀 3.3. 質譜法 檢測周期:4-6周 檢測平臺:MassARRAY 質譜儀 4. SNP檢測技術 SNP檢測共20多種檢測方法,針對不同細分應用,不同應用場景可以選擇不同的檢測方法。但是總體來說,檢測成本必將隨著技術水平的提高,檢測量的提升會不斷下降,同時也會向著更為便利和準確的方向發展。
3.2. SNaPshot法