取葉片→磨樣→提取DNA→PCR擴增→電泳檢測→染色→讀帶標記。
1、DNA提取
按照Doyle和Dickson(1987)CTAB法(`Cetyl triethyl ammonium bromide)并略加改進的程序進行,具體步驟如下:
① 成熟期取葉片加液氮研磨成粉末狀,轉入1.5ml離心管中,-20℃冰箱保存;
② 加入600μl 65℃的2×CTAB混勻并置于65℃水浴中保溫30-60分鐘;
③ 取出,冷卻,上下搖勻后,加入600微升24:1的氯仿異戊醇;
④ 12000轉/分鐘離心10分鐘,取上清液于另一個1.5ml的離心管中;
⑤ 加異丙醇,12000轉/分鐘離心10分鐘,倒掉上清液;
⑥ 干后用100%的灑精清洗,干后加適量TE。2、PCR擴增
模板DNA的濃度大約25ng/μl,擴增反應體系為20μl。具體如下:
Sterile ddH2O 11μl
PCR Buffer 3μl
dNTP-mix 0.5μl
Primer1 1μl
Primer2 1μl
Taq polymerase 0.5ul(2U/μl)
DNA 3μl
PCR擴增程序為:(2h30min)
① 預變性:94℃,5分鐘;
② 變 性:94℃,40秒;
③ 退 火:55℃ 40秒;
④ 延 伸:72℃,1分鐘;
⑤ 循 環:從2到4共38個循環;
⑥ 72℃下最后延伸5分鐘;4℃ 5min,擴增產物置于4℃的冰箱保存。3、擴增產物的電泳分離
制膠→灌膠→上樣→電泳。
擴增產物用8%的聚丙烯酰胺變性膠電泳分離,步驟如下:
① 準備電極液(1×TBE);
② 將梳子撥出,并迅速用電極液沖洗膠面;
③ 不預電泳;
④ 點樣,電泳220V;
⑤ 拆板,并及時將內板、邊條及梳子洗凈。
4、凝膠染色
① 固定:10%醋酸,5分鐘;
② 染色:10分鐘;
③ 漂洗:dH2O,5-10秒;
④ 顯色:甲醛-NaOH,直到滿意為止;
⑤ 漂洗:dH2O,2分鐘。
5、自封帶封膠,讀帶標記,數碼照相攝像,室溫風干。 收起 |