Science：構建出真渦蟲細胞類型轉錄組圖譜

　　真渦蟲是一類相對簡單的動物，具有不同尋常的生物學特征：成年真渦蟲維持著其他有機體僅在胚胎中短暫存在的發育信息和祖細胞（progenitor cell）。真渦蟲獲得人們的大量研究，部分原因在于它們具有再生丟失的或受損的身體部位的獨特能力。

圖片來自Christopher Fincher/Whitehead Institute

　　在一項新的研究中，來自美國懷特海德研究所和麻省理工學院的研究人員分離出來自一種真渦蟲（具體而言是地中海圓頭渦蟲，學名Schmidtea mediterranea）的5個身體區域的總共66783個細胞，并利用單細胞RNA測序術系統性地分析了這些細胞，揭示出一個完整有機體中幾乎每種類型細胞的全部活性基因（或者說“轉錄組”），包括罕見的真渦蟲細胞類型（比如在由大約50萬～100萬個細胞組成的成年真渦蟲動物中，一種罕見的細胞類型僅有大約10個細胞）的轉錄組。這種轉錄組圖譜代表著關于真渦蟲（planarian）的生物信息寶庫。這種新的公開可用的資源（網址為：http://digiworm.wi.mit.edu）推動了重要的發現，包括鑒定出新的真渦蟲細胞類型和能夠傳遞來自肌肉細胞的位置信號的新基因---這是組織再生的一個關鍵因素。相關研究結果于2018年4月19日在線發表在Science期刊上，論文標題為“Cell type transcriptome atlas for the planarian Schmidtea mediterranea”。

　　此外，這些人員發現了一些在此之前從未在真渦蟲中描述過的細胞類型，以及許多有機體共有的細胞類型，這就使得這種轉錄組圖譜成為整個科學界的寶貴工具。論文通信作者、懷特海德研究所研究員和麻省理工學院生物學教授Peter Reddien說，“我們鑒定出很多在真渦蟲體內廣泛分布的但之前未被鑒定出的細胞。這一令人吃驚的發現突出了這種方法在鑒定新細胞方面的巨大價值。這種方法可能廣泛地應用于許多未知的有機體中。”