Western Blot樣品制備是這個實驗的第一步。而且是關鍵步驟,要求盡可能的獲得所有蛋白質。所以我們在做wtstern blot實驗應注意以下問題:
1:在合適的鹽濃度下,應保持蛋白質的最大溶解性和可重復性。
2:選擇合適的表面活性劑和還原劑,破壞所有非共價結合的蛋白質復合物和共價鍵二硫鍵,使其形成一個各自多肽的溶液。
3:盡量去除核酸,多糖,脂類等干擾分子。
4:防止蛋白質在樣品處理過程中的人為的修飾,制備過程應在低溫下進行,以避免細胞破碎釋放出的各種酶類的修飾(建議加入合適的蛋白酶抑制劑)
5:樣品建議分裝成合適的量,然后冷凍干燥或直接以液體狀態置-80℃中保存,但要注意不要反復凍融。
下面我們詳細介紹一下western blot實驗的詳細步驟。
一.準備工作:
一個水浴箱,一臺超聲裝置,組織勻漿器
二.需要的溶液:
裂解液 Laemmli樣品緩沖液
三.操作步驟:
1)培養細胞蛋白質樣品的制備:
1:胰酶酶解后裂解:
細胞培養至80%左右密度時,以含0.05%胰蛋白酶消化,細胞經預冷的PBS漂洗3次,離心收集在離心管中,加入450μl裂解液反復吹打。
2:皿上直接裂解:
細胞培養至80%左右密度時,細胞經預冷的PBS漂洗3次,加入450μl裂解液,細胞刮刀收集,用移液器轉移至離心管中,反復吹打。
以上所得的樣品最終用超聲細胞破碎儀超聲處理,超聲時為5S,間歇時間為10S,功率為100-120W至溶液清澈無粘稠為止,處理過程在水浴中進行,后4℃25000g離心1小時取上清或以最大強度超聲4次,每次15-30S,在每次超聲步驟之間將樣品轉置水浴中15S,加入Laemmli 樣品緩沖液(視蛋白樣品濃度,以1:1或1:2的比例混合),強力混勻,樣品置100℃水浴箱里水浴加熱3-5分鐘,10000g離心10分鐘,取出清液,將其移入另一潔凈試管中,至此,電泳樣品已準備就緒。(樣品可立即使用也可以分裝凍存,-20℃存放的樣品可穩定保持數月)。
2)組織樣品的制備:
手術切除的組織塊迅速置于預冷的0.95生理鹽水中,漂洗數次,以清潔表面的血跡,將組織稱量后切成幾個較小的組織塊放入機戒組織勻漿器中,按組織凈重,裂解液=1:10的比例,加入相應體積的裂解液進行勻漿,離心收集上清(如有粘稠物可超聲處理,具體方法見細胞培養的樣品制備,也可以冷凍干燥降解核酸后,將凍干的蛋白質樣品溶解在適當的上樣 buffer中,混勻后靜置3小時使樣品中的蛋白質充分的溶解,有5分鐘即可,4度離心收集。)加入Laemmli樣品緩沖液(視蛋白樣品濃度,以1:1或1:2的比例混合)強力混勻,樣品置100度的水浴箱水浴加熱3-5分鐘,10000g離心10分鐘,取上清液,將其轉入另一潔凈的試管中,至此,電泳樣品已準備就緒(樣品即可立即使用也可也可以分裝凍存,-20℃存放的樣品可穩定保持數月。)
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