昆明植物所完成六種木本竹子葉綠體基因組全序列的測定
竹亞科(Bambusoideae)隸屬于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余種。木本竹子因種類數目多,形態性狀復雜多變及多年生一次性開花等原因而成為系統發育學研究難點。隨著新一代測序技術的興起,系統發育基因組學為解決這類困難類群的系統發育關系帶來了曙光。 中國科學院昆明植物研究所李德銖研究組對木本竹子的研究有較好的研究基礎。最近,該研究組選取1種熱帶竹子和5種溫帶竹子,利用新一代測序技術Illumina測定了這些種的葉綠體基因組全序列。通過與已知的2種竹子葉綠體基因組序列比對發現,竹亞科植物的葉綠體基因組非常保守,具有良好的共線性和較低的分子進化速率,并證實了通過改良高鹽低pH法直接分離葉綠體DNA并測序這一方法的可行性。 基于24種禾本科植物葉綠體基因全序列,該研究組還構建了禾本科的系統發育樹。在BEP分支中,竹亞科和早熟禾亞科(Pooideae)的姐妹群關系得到了強烈的支持。首次從系統發育基因組學的角度證實......閱讀全文
版納植物園葉綠體比較基因組學研究取得進展
樟科油丹屬樹種木材質優,國際市場上的商品名為“medang”,和楠木樹種的親緣關系較近。以往的分子系統學研究表明油丹屬為復系類群,但與潤楠屬、鱷梨屬和楠屬等的系統關系尚不明晰。 近日,中國科學院西雙版納熱帶植物園生物多樣性研究組以分布于印度南部的油丹模式種Alseodaphne semecar
武漢植物園在裸子植物葉綠體基因組學研究方面獲進展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我國特有珍稀瀕危植物,屬裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉屬(Cephalotaxus)。它在三尖杉屬中的地位特殊,形態、解剖、胚胎發育、孢粉、核型及分子系統學的研究均支持將其獨立成篦子三尖杉組。 松杉類植物
昆明植物所山茶屬代表植物比較葉綠體基因組學研究獲進展
山茶屬是山茶科中包含許多舉世聞名經濟植物的一個重要類群,包括為人類提供天然保健飲料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高級食用植物油的油茶(C. oleifera)以及觀賞花卉云南山茶(C. reti
葉綠體亞分級實驗——葉綠體亞分級
實驗材料葉綠體試劑、試劑盒裂解緩沖液儀器、耗材微量離心管小型離心機實驗步驟1. 將含 1 mg 葉綠素的葉綠體懸液吸至一微量離心管中。2. 在小型離心機中 14000 r/min 離心 30 秒鐘,棄去上清。3. 加 1 ml 裂解緩沖液,振蕩,冰浴 5 分鐘。裂解緩沖液:10 mmol/L HEP
從豌豆組織分離葉綠體實驗_葉綠體分離
實驗材料葉子組織試劑、試劑盒PBF-Percoll 溶液山梨醇BSAHEPES-KOHEDTA儀器、耗材聚碳酸酯離心管實驗步驟1. 制備 Percoll 梯度(1) 兩個 50 ml 的聚碳酸酯離心管中分別加入 25 ml 50% 的 PBF-Percoll 溶液。50% PBF-Percoll0.
葉綠體(chloroplast)分離
設備:Hitachi CF—7D2離心機,T5SS或T4SS或T7A轉頭50ml PP 離心管CP—MX ,CP—WX超速離心機,R28S轉頭,40ml PA管。(或其他品牌離心機,同類轉頭)溶液配置:A液:0.35M Sorbitol,(山梨醇),50mM Tris—HCL (PH8.0) 5mM
葉綠體DNA分離
設備:Hitachi CS-150GXL或CS-120GXL微量超速離心機,S100AT6 轉頭,5PA 密封管(如果用4PC管,可接比例減少各層液量)溶液配制:A液:0.35Msorbitol(山梨醇),50mM Tris—Hcl (PH8.0) 25mM EDTA—Na2B液:5%(w/w)So
葉綠體是什么
葉綠體是質體的一種, 是高等植物和一些藻類所特有的能量轉換器。葉綠體是含有綠色色素(主要為葉綠素 a 、b)的質體,為綠色植物進行光合作用的場所,存在于高等植物葉肉、幼莖的一些細胞內,藻類細胞中也含有。葉綠體的形狀、數目和大小隨不同植物和不同細胞而異。
什么是葉綠體
葉綠體葉綠體(chloroplast)植物綠色細胞中存在的有色質體。其內含有葉綠素及類胡蘿卜素,是進行光合作用的場所。在高等植物中一般呈橢圓形,長軸4~10微米,短軸2~4微米。它被雙層膜(稱為外被)包圍著,內部為層膜系統和基質(或稱間質)所組成。在電鏡下觀察,每一層膜是由雙層膜組成扁平的囊,中間是
昆明植物所建立葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系
在分子生物學和基因組時代,葉綠體基因組為植物分類、系統發育和物種鑒定等提供了不可或缺的遺傳信息。隨著新一代測序技術的快速發展,葉綠體基因組學已經成為植物系統基因組學和超級條形碼研究的熱點,也是中國科學院昆明植物研究所三個重大突破目標——iFlora 研究的重要內容。 昆明植物所種質資源庫多年來
葉綠體基因組
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能的重要細胞器,葉綠體中進行的光合作用是嚴格地受到遺傳控制的。早在20世紀初,人們就已知葉綠體的某些性狀是呈非孟德爾式遺傳的,但直到60年代才發現了葉綠體DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。葉綠體基因組是一個裸露的環狀雙鏈DNA分子,其大小在1
葉綠體亞分級實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 葉綠體 試劑、試劑盒 裂解緩沖液 儀器、耗材
葉綠體亞分級實驗
實驗材料 葉綠體試劑、試劑盒 裂解緩沖液儀器、耗材 微量離心管小型離心機實驗步驟 1. 將含 1 mg 葉綠素的葉綠體懸液吸至一微量離心管中。2. 在小型離心機中 14000 r/min 離心 30 秒鐘,棄去上清。3. 加 1 ml 裂解緩沖液,振蕩,冰浴 5 分鐘。裂解緩沖液:10 mmol/L
葉綠體的功能簡介
光合作用是葉綠素吸收光能,使之轉變為化學能,同時利用二氧化碳和水制造有機物并釋放氧的過程。這一過程可用下列化學方程式表示:6CO2+6H2O( 光照、酶、 葉綠體)→C6H12O6(CH2O)+6O2。其中包括很多復雜的步驟,一般分為光反應和暗反應兩大階段。 光反應:這是葉綠素等色素分子吸收,
葉綠體基因的定義
葉綠體基因:cpDNA,環狀,可自主復制,也受核基因控制。
葉綠體的相關介紹
葉綠體(Chloroplast)是質體的一種,是高等植物和一些藻類所特有的能量轉換器。其雙層膜結構使其與胞質分開,內有片層膜,含葉綠素,故名為葉綠體。 葉綠體是含有綠色色素(主要為葉綠素 a 、b)的質體,為綠色植物進行光合作用的場所,存在于高等植物葉肉、幼莖的一些細胞內,藻類細胞中也含有。葉
機械法分離葉綠體
一、原理研磨葉片得到的勻漿,經過濾、離心可制備葉綠體。葉綠體的被膜比較脆弱,分離葉綠體應在等滲的緩沖溶液中,0~4℃溫度下進行。葉綠體活力會隨著離體時間延長而不斷下降,因此,分離工作盡可能在短時間內完成。二、儀器與用具冰箱;離心機;扭力天平;顯微鏡;pH計;研缽;量筒;移液管;離心管;脫脂紗布等。分
葉綠體亞分級實驗
葉綠體亞分級實驗材料葉綠體 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?試劑、試劑盒裂解緩沖液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?儀器、耗材微量離心管
葉綠體和光合色素
一、葉綠體 葉片是光合作用的主要器官,而葉綠體(chloroplast,chlor)是光合作用最重要的細胞器。(一)葉綠體的發育、形態及分布1.發育 高等植物的葉綠體由前質體(proplastid)發育而來,前質體是近乎無色的質體,它存在于莖端分生組織中。當莖端分生組織形成葉原基時,前質體的雙層膜中
葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系建立
記者日前從中科院昆明植物所獲悉,該所種質資源庫多年來致力于葉綠體基因組學研究,并建立了較為完善的葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系。該技術體系解決了葉綠體基因組獲取方法需要大量新鮮材料以及一些物種因個體微小須通過二代測序方法獲取葉綠體基因組的難題。 2012年以來,科研人員利用二代測序技術研究了
葉綠體DNA的結構特點
葉綠體DNA,英文chloroplast?DNA,縮寫cpDNA,存在于葉綠體內,雙鏈環狀,長度中間值通常為45微米,具有獨立基因組。一個葉綠體含有10~50個cpDNA。
葉綠體DNA的基本結構
葉綠體DNA,英文chloroplast?DNA,縮寫cpDNA,存在于葉綠體內,雙鏈環狀,長度中間值通常為45微米,具有獨立基因組。一個葉綠體含有10~50個cpDNA。
葉綠體色素的定量測定
【原理】根據葉綠體色素提取液對可見光譜的吸收,利用分光光度計在某一特定波長下測定其光密度,即可用公式計算出提取液中各色素的含量。根據朗伯—比爾定律,某有色溶液的光密度D與其中溶質濃度C和液層厚度L成正比,即:D=kCL式中:k為比例常數。當溶液濃度以百分濃度為單位,液層厚度為1cm時,k為該物質的比
葉綠體DNA的結構特點
葉綠體DNA,英文chloroplast?DNA,縮寫cpDNA,存在于葉綠體內,雙鏈環狀,長度中間值通常為45微米,具有獨立基因組。一個葉綠體含有10~50個cpDNA。
細胞化學基礎葉綠體DNA
葉綠體DNA,英文chloroplast?DNA,縮寫cpDNA,存在于葉綠體內,雙鏈環狀,長度中間值通常為45微米,具有獨立基因組。一個葉綠體含有10~50個cpDNA。
葉綠體DNA的基本介紹
chloroplast DNA(cpDNA),存在于葉綠體內的DNA。高等植物葉綠體的DNA為雙鏈共價閉合環狀分子,其長度隨生物種類而不同,其大小在120kb到217kb之間,相當于噬菌體基因組的大小,例如,T4噬菌體的基因組約165kb。葉綠體DNA不含5-甲基胞嘧啶,這是鑒定cpDNA及其純
關于葉綠體DNA的介紹
chloroplast DNA(cpDNA),存在于葉綠體內的DNA。高等植物葉綠體的DNA為雙鏈共價閉合環狀分子,其長度隨生物種類而不同,其大小在120kb到217kb之間,相當于噬菌體基因組的大小,例如,T4噬菌體的基因組約165kb。葉綠體DNA不含5-甲基胞嘧啶,這是鑒定cpDNA及其純
葉綠體色素的定量測定
實驗方法原理根據葉綠體色素提取液對可見光譜的吸收,利用分光光度計在某一特定波長下測定其光密度,即可用公式計算出提取液中各色素的含量。根據朗伯—比爾定律,某有色溶液的光密度D與其中溶質濃度C和液層厚度L成正比,即:D=kCL式中:k為比例常數。當溶液濃度以百分濃度為單位,液層厚度為1cm時,k為該物質
細胞化學基礎葉綠體DNA
chloroplast DNA(cpDNA),存在于葉綠體內的DNA。高等植物葉綠體的DNA為雙鏈共價閉合環狀分子,其長度隨生物種類而不同,其大小在120kb到217kb之間,相當于噬菌體基因組的大小,例如,T4噬菌體的基因組約165kb。葉綠體DNA不含5-甲基胞嘧啶,這是鑒定cpDNA及其純度的
二代測序技術助龍膽族葉綠體基因組進化和系統學獲進展
隨著二代測序技術的發展,植物葉綠體基因組序列已普遍應用于重建植物“生命之樹”研究中。大多數植物葉綠體基因組呈環狀四分體結構,包含約80個蛋白編碼基因。葉綠體基因組由于缺乏重組,而常被認為是連鎖的單一基因座;然而,越來越多的研究表明,葉綠體基因組中不同區域以及不同編碼基因具有不同的核酸替代速率,經