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  • RNA修飾技術在華南農大余義勛組植物m1A調控機制的運用

    RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用,m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修飾在植物中的研究還非常少。 近日,Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The N1-methyladenosine methylome of petunia messenger RNA” 的研究論文。研究結果顯示RNA m1A修飾在植物生長發育中起著重要作用。 矮牽牛RNA m1A修飾促進生長發育 圖片1.png 發表期刊:Plant Physiology 影響因子:6.305 發表時間:2020.05.27 實驗方法: m1A-seq, RNA-seq(云序提供) 此研究由云序生物合作客戶華南農業大學余義勛課題組完成的,該課題組利用m1A-seq & RNA-seq(本實驗云......閱讀全文

    研究揭示染色質修飾調控植物基因表達新機制

      8月6日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室何躍輝研究組(與劉仁義研究組合作)和杜嘉木研究組(與美國威斯康辛大學鐘雪花研究組合作)在《自然-遺傳學》背靠背分別發表題為Polycomb-mediated gene silencin

    乙酰化修飾調控植物向光性分子機制獲揭示

    近日,中國科學院華南植物園研究員劉勛成團隊在國家自然科學基金和廣東省科技計劃等項目的資助下,研究揭示了乙酰化修飾調控植物向光性分子機制。相關成果發表于《植物通訊》(Plant Communications)。分子模式:HDA9介導phot1乙酰化-磷酸化動態平衡調控植物向光性。研究團隊供圖植物的向光

    華南植物園在植物葉片發育表觀遺傳調控研究中獲進展

      組蛋白去乙酰化酶(HDAC)在染色體的結構修飾和基因表達調控中發揮著重要的作用。HDAC通過去乙酰化作用移除核心組蛋白N-末端的乙酰基,增加 DNA與組蛋白之間的引力,使松弛的核小體變得十分緊密,從而抑制基因轉錄的起始與表達。研究表明,HDAC在植物生長發育過程中發揮重要調控作用。 AS

    陳捷凱課題組發現RNA-m6A修飾調控異染色質形成的新機制

      近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員陳捷凱課題組發現了RNA m6A修飾調控異染色質形成的新機制,闡明了RNA m6A閱讀器YTHDC1在這一機制中的關鍵作用:抑制基因組中廣泛分布的ERVK、IAP、LINE1等轉座元件限制胚胎干細胞向全能性干細胞轉化,相關研究成果以The RNA m

    植物所解析RNA甲基化調控果實成熟的作用機制

      DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是兩種重要的核酸修飾,在基因表達調控中發揮重要作用并參與諸多生物學過程。然而,這兩種核酸修飾之間是否存在內在關聯性卻不清楚。近日,中國科學院植物研究所秦國政研究組和田世平研究組合作,揭示了DNA甲基化可通過調節m6A去甲基化酶基因表達的方式影響番茄果

    上海植物逆境中心建立植物基因組精確定點修飾技術

      中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組近日通過模仿和改造微生物中的一種抵御外源侵染的防護機制,成功開發出一種能對植物基因組進行精確定點修飾的技術,從而使高效植物分子改良性狀成為可能。這一適用于植物的CRISPR/Cas技術就像一把剪刀可以對基因組任意感興趣的位置進行編輯,它的成功開發將革命

    Nature:RNA-修飾研究有助表觀轉錄組學進一步發展

      這是一個與 mRNA 結合的細菌核糖體的分子模式圖,該核酸蛋白復合體正在合成蛋白質。  隨著科研人員逐漸揭開 RNA 修飾的奧秘,幫助我們了解表觀轉錄組學(epitranscriptomics)的工具也變得越來越多了。  2004 年,以色列特拉維夫大學(Tel Aviv University

    睪丸間質細胞(LCs)m6A修飾提供新治療靶點在不育癥...3

    總結:?細胞的生長與分化依賴于基因的調控表達方式,越來越多的研究表明m6A 甲基化在更多領域發揮著關鍵作用,而本文作者正是利用多組學MeRIP,?RIP,?CoIP,?CHIP(云序生物提供此服務)等多種技術聯合分析,揭示了m6A修飾通過影響Camkk2轉錄的穩定性和Ppm1a的翻譯效率調節LC

    謝旗研究組發表泛素化修飾調控植物低磷脅迫響應的綜述

      磷是植物生長發育必需的大量元素之一,土壤中低磷脅迫會影響植物的生長并影響作物的產量。我國是世界上磷肥使用量最大的國家,施用磷肥在提高作物產量的同時也帶來了一系列環境污染問題。因此,解析植物對低磷脅迫的響應機制并培育磷高效利用的作物是作物育種上的一個重要研究方向。  泛素化修飾是一種重要的蛋白質翻

    雙義RNA的概念

    部分基因的表達需要先進行轉錄合成出亞基因組RNA,作為mRNA翻譯出蛋白質;另一部分基因的表達需要先經過基因組復制出互補鏈,再以互補鏈為模板轉錄出亞基因組RNA,作為mRNA使用。

    我國研究院揭示m6A修飾對AtoI-類RNA編輯的調控作用

      A-to-I類型的RNA編輯是一種基本的生物學現象,廣泛存在于哺乳動物中,目前被認為是一種能夠產生分子多樣性的轉錄后修飾機制,通過重新編碼來調節蛋白質翻譯,大大豐富了遺傳信息。A-to-I類型的RNA編輯不僅對基因表達調控具有重要影響,而且還與很多疾病的發生發展過程密切相關。m6A 修飾對 A-

    劉勛成等研究揭示植物光響應基因轉錄調控機理

      近日,中科院華南植物園的一項研究揭示了植物光響應基因轉錄調控新機理,為農作物高產育種提供了重要的理論基礎。相關研究發表在《植物細胞》上。   在高等植物中,光敏色素通過與一類bHLH轉錄因子——光敏色素互作蛋白(PIFs)相互作用、傳遞光的信號從而影響植物的生長發育。然而,對光敏色素互作蛋白如

    華南植物園等在兜蘭花期調控研究中取得進展

    兜蘭屬植物花型獨特,具有觀賞價值,開花時間與開花豐度是決定兜蘭觀賞價值的重要農藝性狀。市場上的兜蘭多為人工栽培的單花雜交種,由于其開花習性多樣,多采取自然開花的生產模式,沒有穩定的花期調控技術,影響了其產業化發展。所有單花種兜蘭均能分化出多個花芽,但常常只有一朵能正常開放,其余花芽常敗育。目前關于兜

    華南植物園在重金屬毒性調控研究取得重要進展

    環境中的有毒金屬通過各種途徑進入食物鏈,并可能對人體造成多種危害,例如鎘過量攝入引起骨脆性或腎損傷,鉛會導致腎、腦中毒(神經膠質瘤)等。某些特定膳食補充劑(維生素族、抗氧化劑、礦質元素)具有緩解重金屬脅迫和毒性的作用,但其對腸道過程中降低重金屬生物有效性的影響機制尚不清楚,因此探索飲食干預對重金屬的

    華南植物園森林土壤溫室氣體通量調控機制研究獲進展

      目前已有的研究結果顯示出調控森林土壤主要溫室氣體(CO2,CH4, N2O)通量的因素很多,如外部環境因子(溫度、降水、氮沉降等),土壤特性(物理、化學、生物等)等,但如何量化這些因素的調控作用并沒有得到很好的解決,成為這些氣體通量模型發展的瓶頸。   中科院華南植物園生態及環境科學研究中

    跨學科合作將成為解碼植物表觀轉錄組的加速器

      近日,中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所教授呂培濤在《生物技術通報(英文)》(aBIOTECH)發表了綜述論文。文章系統闡述了RNA修飾在植物生命活動中的調控作用,深入解析了N6—甲基腺苷(m6A)等修飾對植物發育及果實成熟的分子機制。  真核生物RNA上存在170多種化學修飾,形成動態可逆的

    揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性

      m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。   2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院北京基因組研究所

    揭示腸道細菌調控表觀轉錄組修飾促進結直腸癌轉移機制

      結直腸癌是常見惡性腫瘤之一,是全世界發病人數第三、死亡人數第二的惡性腫瘤。結直腸癌在我國同樣不容樂觀。盡管結直腸癌的治療手段不斷發展,但晚期轉移性結直腸癌患者的預后生存仍然不理想,我們需要對結直腸癌的轉移機制有更深刻的認識。  近年來,隨著宏基因組測序等研究手段的不斷進展,人們發現腸道菌群能廣泛

    華南農大:miRNA調控植物對鎘的應激反應

       土壤中的重金屬污染是一個世界范圍內嚴重的環境問題,主要是由于一些人為活動,如采礦,工業活動和有機磷的使用等造成。土壤中鎘(Cd)可以很容易地被植物吸收,從而導致各種中毒癥狀,如降低生物量,葉片失綠,抑制根系生長,發生形態學改變,甚至植株死亡。大量研究表明,在植物中,microRNA(miRNA

    種康院士團隊揭示植物糖基化修飾調控開花新機制

      蛋白質糖基化是一種重要的蛋白質翻譯后修飾方式,在復雜的生命活動中扮演重要角色。常見的糖基化,如N-糖基化和O-糖基化,蛋白質一般會被修飾上結構復雜的糖鏈。  然而,生物體中還存在一種常見但比較特殊的糖基化,它僅在蛋白質上修飾一個單糖。在此修飾中,N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)通過O-糖苷鍵連

    可逆蛋白質修飾調控植物發育與免疫平衡機制獲揭示

    在國家自然科學基金、廣東省自然科學基金等項目的資助下,華南師范大學生命科學學院教授陽成偉/賴建彬團隊研究揭示了BON1蛋白的可逆棕櫚酰化修飾通過影響細胞內吞作用調控植物發育與免疫平衡的機制。10月10日,相關成果發表于《分子植物》(Molecular Plant)。面對自然界中病原體的侵襲,植物已進

    RNA干擾技術在植物學中的應用

      Napoli等將1個查爾酮合成酶基因(chs)置于1個強啟動子后導人矮牽牛(Petunia hybrida),試圖加深花朵的紫顏色。結果部分花的顏色并非期待中的深紫色,而是形成了花斑狀甚至白色,而且這種性狀可以遺傳。因為導入的基因和其同源的內源基因同時都被抑制,他們將這種現象命名為共抑制(co-

    m6A修飾的長鏈非編碼RNA調控神經元的發育及機制

      近日,Cell Reports在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生物化學與細胞生物學研究所)鮑嵐研究組的最新研究進展(m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF

    揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性

      文章導讀   m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。   2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院

    黃勛研究組PLoS揭示脂代謝與細胞生長發育協同調控新機制

      多細胞生物的個體及器官大小是如何決定的是發育生物學領域一個基礎的生物學問題。在細胞生長過程中,脂質扮演著重要的角色。例如,磷脂是各種膜結構 的主要組分,而脂肪則是生物體內能量的主要貯存形式。細胞的生長需要動員貯存在機體內的大量能量,同時也需要許多結構脂質來滿足細胞各種膜組分擴張的需 要。

    脈動真空在堯勛滅菌器的運用

      滅菌鍋可以說是實驗室常用設備之一,對于樣品的消毒、滅菌都離不開它!可是常常碰到了脈動真空這個選配項時,都會有點躊躇。脈動真空到底是什么呢?對于實驗又有什么幫助呢?   堯勛普通滅菌鍋滅菌過程包括:   普通的滅菌鍋的蒸汽自然蒸發趕出冷空氣,對于一般廣口的器皿是完全沒有問題的,但是對于

    華南植物園在檀香冷響應機制研究中取得進展

      植物與環境之間存在著極為密切的聯系。任何植物,無論是一個個體,還是群體,都需要隨時隨地應對所在的環境并做出積極的響應,這是生命維持其存在和發展的必由之路。冷脅迫是阻礙植物生長、限制其地理分布與減少農作物產量的主要的非生物因子之一。檀香(Santalum album L., sandalwood)

    植物基因組DNA及總RNA提取技術1

    幼嫩組織的細胞處于旺盛的分裂階段,核較大而胞質較少,核酸濃度高,且內含物少、次生代謝產物少,蛋白質及多糖類物質相對較少,在SDS或 CTAB物質存在時,經機械研磨,使細胞破裂并釋放出內含物,提取的DNA、RNA的產量高,純度好。?提取DNA所用的提取液、吸頭、離心管等需要高壓滅菌以滅活DNase。R

    植物基因組DNA及總RNA提取技術2

    (二)植物總RNA提取?(1)65°C水浴中預熱15 mL CTAB提取液。?(2)液氮中研磨2~3 g新鮮或-70°C冷凍的材料。?(3)轉移樣品至有CTAB提取液的離心管中,立即激烈渦旋30s,短時放回 65°C水浴中(4~5 min)。?(4)加入等體積的氯仿/異戊醇并渦旋混合,10000 r

    研究揭示RNA去甲基化酶的氧化還原修飾調控番茄果實成熟機制

    活性氧作為重要的信號分子,在植物抵御病原菌侵染、響應逆境脅迫以及維持正常生長發育的多個生物學過程中發揮重要的調控作用。在多種活性氧分子中,過氧化氫具有較長的半衰期,可調控干細胞分化、花粉管伸長、氣孔發育、果實成熟等植物發育過程,但過氧化氫如何與其他信號途徑協同作用,共同調控植物發育過程卻不甚清楚。中

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