快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、BC、HCC當中都是原癌基因，而到了GBM當中竟然變成了抑癌基因；同樣是甲基化酶，在HCC當中，METTL3是原癌基因而METTL14是抑癌基因。不管怎樣這些酶都在疾病當中扮演重要角色，對疾病細胞的侵襲、增殖能力都有所影響，那么如何做到圍繞一個酶把故事的來龍去脈講清楚呢？ RNA甲基化從酶入手，高分文章立刻擁有，截至目前，RNA甲基化相關領域的研究仍在起步階段，但圍繞甲基化酶研究的思路已經是高分文章的首選策略。云序生物課堂，今天就想跟大家聊聊，如何從酶入手打造高分RNA甲基化文章： 1. 確定相應疾病背景下的酶 ......閱讀全文
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
一文了解RNA甲基化機制
1. 什么是RNA甲基化修飾？ 我們知道DNA的甲基化修飾是發生在胞嘧啶（C）上的，而最常見的RNA的甲基化修飾是m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）和尿苷化修飾（uridylation，U-tail）。 m6A修飾在70年代就發現了，是可以發生在mRNA、lncR
RNA－m6A甲基化修飾研究相關研究的應用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話，那么要數對RNA修飾的研究了，此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能，顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力？還是研究從細胞和組織中收集的R
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究匯總—癌癥篇
一個月發表30多篇10分以上的文章，到底是何方神圣？答案：RNA甲基化。今天小編先來介紹一下m6A RNA甲基化。 m6A是真核細胞中mRNAs豐度最高的甲基化修飾，在包括組織發育、干細胞自我更新和分化、熱休克以及DNA損傷應答，母本合子(maternal-to-zygotic)轉化等多個
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
最新進展：RNA的甲基化與去甲基化修飾
德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學（LMU）研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然，只有當細胞處于應激狀態時，這種修飾才會附著在分子上，并且在恢復過程中會迅速去除。 核糖核酸（RNA）在化學形式上與DNA密切相關，而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上，RNA本身在將遺
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
中國農大JBC解析RNA去甲基化酶晶體結構
2014年3月10日，在百年老牌雜志《生物化學雜志》（Journal of Biological Chemistry）發表的一項最新研究中，中國農業大學、清華大學和多倫多大學的研究人員，報道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5個高分辨率晶體結構。該研究的通訊作者為中國農業大學的陳忠周教
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化，作為最新的國
RNA甲基化位點分析新方法
繼上次QB期刊給大家推薦了WendyV. Gilbert教授的《關于pre-mRNA存在的修飾形式及其對剪接的影響》綜述后，小編看到讀者們的熱情度特別高。借此機會，再給大家推薦一篇來自德克薩斯大學西南醫學中心，QBRC、BICF中心主任謝陽教授實驗室在QB期刊上發表的最新關于分析MeRIP-Se
m5C－RNA甲基化測序介紹
m5C RNA甲基化簡介通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊。RNA甲基
2018國自然研究熱點二：－RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達 17 篇。 圖：
高產學者Nature揭示RNA甲基化的新功能
MicroRNA（miRNA）是一類約22nt大小的內源RNA，在基因表達中起著重要的調控作用，參與了多種生理和病理過程。miRNA生成是一個復雜的過程，初級miRNA（pri-miRNA）需要經過細胞核和細胞質內的一系列加工才能形成成熟的miRNA。 整個流程的第一步是microproces
擬南芥RNA核糖甲基化修飾研究方面獲進展
3月30日，中國科學院生物物理研究所研究員葉克窮課題組、北京大學現代農學院博士王玉秋和中科院遺傳與發育研究所研究員李家洋課題組合作在Nucleic Acids Research上發表了題為Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
RNA甲基化調控基因出核新機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂研究組和鄭州大學第一附屬醫院生殖與遺傳專科醫院孫瑩璞研究組、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究組合作研究，揭示了m5C（5-甲基胞嘧啶）修飾在mRNA的分布圖譜規律及其對調控mRNA出核作用新機制。該研究成果以5-
新型植物RNA甲基化編輯工具研發成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519898.shtm近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內多家單位成功開發出新型植物RNA甲基化編輯工具。該研究對作物基因編輯育種有重要的潛在應用價值。相關研究成果發表在《植物生物技術》（Pla
高產學者Nature揭示RNA甲基化的新功能
MicroRNA（miRNA）是一類約22nt大小的內源RNA，在基因表達中起著重要的調控作用，參與了多種生理和病理過程。miRNA生成是一個復雜的過程，初級miRNA（pri-miRNA）需要經過細胞核和細胞質內的一系列加工才能形成成熟的miRNA。 整個流程的第一步是microproces
新型植物RNA甲基化編輯工具研發成功
記者10月6日從華中農業大學獲悉，該校棉花遺傳改良團隊開發出基于CRISPR/dCas13（Rx）的新型植物RNA甲基化編輯工具。研究成果日前發表于《先進科學》雜志。N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物mRNA最普遍的內部修飾，可能引起mRNA配對、熱動力和折疊性能的改變，從而影響RNA的可變剪接、翻
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星，也是國自然申請的大熱點；究其原因，是因為最近一兩年，RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展，病毒感染，神經發育，干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天，我們承接上一期的癌癥篇，為您帶來病毒領域的RNA甲基化研究
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
microRNA甲基化助力胰腺癌早期篩查，比CEA更敏感！
在“癌中之王”--胰腺癌面前，似乎所有的治療最終都會化為泡沫，作為一種侵襲性極高的惡性腫瘤，胰腺癌的早期發現率僅為5%-7%，后期化療耐藥性顯著，5年生存率只有5%。其診治之路任重而道遠，在經過多次對其治療的探索失敗之后，科研人員從“三早”入手，終于在該領域取得突破。 研究人員發現，micr
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
SMAD2/3與TGFβ影響轉錄因子發生m6ARNA甲基化調控干細胞發育
文章導讀： 胚胎干細胞作為一種全能性細胞，通過增殖和分化，產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明，胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化，大多與細胞增殖[1-2]，免疫應答[4]關系密切。然而，對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天，分享一
研究發現RNA甲基化調控果實成熟的作用機制
8月7日，《國家科學評論》（National Science Review）在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，