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  • GCMSHRAM代謝組學數據庫探索代謝組學的奧秘

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    非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫?

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    代謝組學常使用的數據庫

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    代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹

      什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的?   代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生

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    代謝組學的研究方法

    代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜

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    基于-Orbitrap-GCMS-的非靶向代謝組學(二)

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    基于-Orbitrap-GCMS-的非靶向代謝組學(一)

    Stefan Weidt,2 Bogusia Pesko,2 Cristian Cojocariu,1 Paul Silcock,1 Richard J. Burchmore,2 and Karl Burgess21Thermo Fisher Scienti_c, Runcorn, UK2Glasg

    基于-Orbitrap-GCMS-的非靶向代謝組學(三)

    使用 SIMCA 軟件進行多變量統計分析。5將結論數據轉化為更為直觀的對數值,將 Y 類別設為各時間點,生成數據的偏最小二乘判別分析(PLS-DA)模型。該軟件生成分數圖和載荷圖,以顯示沿著主成分每個時間點的聚類和分離(圖 6)情況。從本次分析可知,死亡后立即取樣的樣品(RAT_T0)聚集在

    代謝組學新工具:METLIN

      METLIN是由美國Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak開發出的新型數據庫,將能用于解決代謝組學等領域研究中關于數據處理這個大問題。   超過上萬個代謝物   目前METLIN包括有超過10,000個代謝產物中帶有詳細,高分辨率串聯質譜信息的六萬化合物,

    長壽的代謝特征代謝組學研究的啟示

      長生不老是人類自古以來的夙愿。  中國古代神話故事中,有菩提老祖的大品天仙訣,王母娘娘盛會上的蟠桃,太上老祖煉丹爐里的不老丹,還有妖怪們夢寐以求的唐僧肉都可以實現長生不老。在史學瀚海中,《史記》記載秦始皇東巡碣石,攜童男童女入海求仙,尋求長生不老藥;在現代科學中,衰老仍然是生物醫學領域熱門主題之

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    非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些方面?非靶向代謝組學已實現了對眾多生物體系代謝物進行定性和相對定量分析,其結果的分析為各類醫學研究以及藥物開發提供重要參考數據。特別是那些比較好的非靶向代謝組學更是致力挖掘基因與細胞間更深層的關系,現在就非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些

    代謝組學,妙手何來?|邁理奧,開拓代謝組學新科技的先鋒

    今天要講到的代謝組學妙手來自何方??來自我們優秀的用戶——邁理奧(Meliomics)。邁理奧的快速崛起,源自于他們對代謝組學領域的深刻理解和持續創新,而安捷倫出色的儀器和解決方案也為其提供了重要支持。日前,我們有幸采訪到了邁理奧首席科學家厲良教授(加拿大皇家科學院院士)和學術總監李佳博士,深入了解

    如何看待代謝組學的前景

    是不錯的,但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科,一些關鍵性技術還有待突破,如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題,如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究,所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越

    進入前景光明的代謝組學

    內容概要: 一、代謝組學在藥物研發中的應用 二、SiDMAP技術在疾病診斷中的應用 三、儀器公司的研究開發:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研發分析代謝物的更為靈敏的檢測方法,而Bio-Rad公司正在發展用Holly Grail作

    代謝組學——腫瘤研究的利器

      細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的,代謝物更多地反映了細胞所處的環境,比如細胞現在是不是健康?藥物是否起效?環境污染物是不是正在傷害細胞?等等。由此,20世紀90年代,衍生出了一門新學科:代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題:細胞到底發生了什么?  1、腫瘤與代謝組學  腫瘤

    做好代謝組學研究的關鍵

    首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物:(1)對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征;(2)以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點,已成為代謝組學研究的主流技術平臺。其次

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    全新角度探索生命奧秘:脂質組學

      血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。  萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至

    脂質組學:全新角度探索生命奧秘

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    與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有何優點

    那年夏天Forever與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有以下優點:①代謝組學放大了基因和蛋白表達的微小變化,從而使檢測更容易;②代謝組學的研究不需建立全基因組測序及大量表達序列 標簽(EST)的數據庫,且代謝產物的種類要遠小于基因和蛋白的數目.③ 由于給定的代謝產物在每個組織中都是一樣的,所以研究

    代謝組學:未來新方向

       加拿大阿伯特大學生命科學與計算科學教授David Wishart說,我們自身其實就是一大組生化反應,“因此,基因組和蛋白質組不斷進化來支持代謝組,而不是相反的路徑。” Wishart說,有別于其他組學方法,代謝組學提供了一種更加直接的生理狀態檢測方式。代謝組反應營養、脅迫或者疾病狀態的速度比轉

    “代謝組學”技術與方法研究

    【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為:“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”,兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度

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    島津中國行丨武漢大學袁必鋒教授專訪:探索表觀遺傳學與代謝組學的奧秘

    ——訪武漢大學袁必鋒教授2023年9月,走遍中華,尋訪“匠”人“匠”室——“島津中國行”活動來到人杰地靈的千湖之城——湖北武漢。西面是萬里長江,毗鄰最大的內陸湖東湖,坐落其間的就是中國著名的綜合性大學之一,武漢大學。武漢大學成立于1893年,迄今已有百余年的辦學歷史,擁有悠久的歷史和卓越的學術傳統。

    Bruker在ASMS-2016上推出最新代謝組學數據庫

      新型MetaboBASE Personal Library提高分析人員深入進行代謝物鑒定的信心   分析測試百科網訊 2016年6月6日—在ASMS 2016會議上,Bruker推出最新質譜數據庫,被稱為Bruker MetaboBASE Personal Library?,該數

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