羅氏推出序列捕獲新產品
羅氏公司近日宣布推出多款SeqCap EZ Library目標富集新產品。SeqCap EZ Library這種方法可在新一代測序之前實現整個外顯子組或定制區域的富集。這些新產品旨在加強基礎和臨床研究中的遺傳變異發現和檢測，而出色的捕獲效率也能將測序費用降至最低。它們經過優化，適用于各種新一代測序平臺。 新的定制和固定內容外顯子組方案將擴展羅氏現有的外顯子組富集產品線。SeqCap EZ Exome Plus Library讓研究人員能夠在現有的64 MB EZ Exome v3產品上添加高達50 Mb的定制目標，從而創建出自己的目標富集工具，實現總共114 Mb 基因組DNA的靶定和富集。SeqCap EZ Exome +UTR Library則提供了一種擴展的外顯子組富集設計，除了現有的64 Mb EZ Exome v3設計，還包括32 Mb非翻譯區(UTR)，這樣總共能靶定96 Mb的外顯子和UT......閱讀全文
PNAS:外顯子變異檢測——全基因組測序比全外顯子測序更強大
目前，全外顯子測序和全基因組測序技術在遺傳分析和發現導致疾病發生的潛在基因突變方面應用越來越廣泛，隨著測序技術的不斷迭代更新，越來越成熟，昂貴的價格會逐漸降低，那么在排除價格因素之后，全外顯子測序和全基因組測序在檢測外顯子突變方面究竟誰更加強大呢？來自美國的科學家對這一問題進行了相關研究，其研究
NEJM發布基因組和外顯子組測序的臨床指南
誰也沒想到基因組測序技術這么快就進入了臨床實踐。現在，已經不少醫生在測序的幫助下解決了之前難以確診的疾病，尤其是罕見的兒童疾病。兩位著名學者在六月十九日的《新英格蘭醫學》雜志上發表文章，為醫生們提供了測序臨床應用的入門指南，幫助他們更有效的利用這一新技術。 “這篇文章為醫生們提供了可以遵循的
全基因組與外顯子組測序在臨床診斷中的應用
全基因組或外顯子組測序的臨床應用，稱為臨床基因組和外顯子測序( Clinical genome and exome sequencing，CGES）。由于該技術檢測范圍廣，可以同時檢測2000多個基因的變異，對于臨床罕見病、疑難疾病、復雜疾病，特別是孟德爾遺傳病的診斷是一種強大而有效的方法。
外顯子應用機理
應用聚合酶鏈反應-單鏈構象多態性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接測序技術檢測68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外顯子。
什么是外顯子？
斷裂基因中的編碼序列。外顯子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后會被保存下來,并可在蛋白質生物合成過程中被表達為蛋白質。外顯子是最后出現在成熟RNA中的基因序列,又稱表達序列。
全基因組連鎖分析和外顯子測序非綜合征耳聾家系中鑒定
伯豪客戶應用全基因組連鎖分析和外顯子測序在非綜合征耳聾家系中鑒定 DMXL2致病變異 期刊：Genet Med 影響因子：7.710 發表時間：2016 使用服務：Illumina Infinium Human OminiZhongHua-8基因芯片和外顯子
應用全基因組連鎖分析和外顯子測序在非綜合征耳聾家...
應用全基因組連鎖分析和外顯子測序在非綜合征耳聾家系中鑒定DMXL2致病變異期刊：Genet Med影響因子：7.710發表時間：2016使用服務：Illumina Infinium Human OminiZhongHua-8基因芯片和外顯子組測序家系連鎖分析則是研究單基因遺傳疾病致病基因/位點的最有
美國首次公布全外顯子測序參保標準－但對全基因組測序拒保
日前，美國保險公司Cigna公布了一項關于基因測序的新參保政策，該政策強調全外顯子測序（WES）和全基因組測序（WGS）的參保條件等問題。該政策由美國保險公司Cigna與InformedDNA公司的遺傳學專家共同制定，是美國國家健康體系首次發布全外顯子測序的參保標準。 全外顯子測序參保標準
外顯子混編的功能
即新的基因是由原來的基因打斷后的斷片混編而成的,或者是由編碼蛋白質結構域的基因片段混編而成。這種基因片段可能就是外顯子,因此稱為外顯子混編。
外顯子的基因反應
剪接方式并不是唯一的(參看替代剪接),所以外顯子只能在成體mRNA中被看出。即使是使用生物信息學方法,要精確預測外顯子的位置也是非常困難的,外顯子的識別及其拼接都是難題。?真核生物的基因,其線性表達被內含子阻斷,這就是所謂的斷裂基因(英語splitgene),該現象的發現者RichardJ.Robe
外顯子跳讀的概念
中文名稱外顯子跳讀英文名稱exon skipping定 ?義跳過一個或多個外顯子剪接為成熟的mRNA,是mRNA剪接多樣性中的一種主要方式。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
什么叫跨外顯子
這是針對逆轉錄pcr而言，所謂的跨外顯子就是一個引物（比如上游引物）、出現在兩個外顯子交界，那么做RT-PCR時，dna 由于2個外顯子被內含子隔開，引物就不會起作用了
外顯子重復的定義
中文名稱外顯子重復英文名稱exon duplication定 ?義(1)一個基因內部產生一個或者多個外顯子的復制拷貝。(2)兩分子同種前體RNA進行反式剪接時,成熟RNA分子上出現重復的外顯子序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)
外顯子插入的定義
中文名稱外顯子插入英文名稱exon insertion定 ?義一個或者多個外顯子從一個基因參入到另一個基因中去的現象。其結果是使剪接更有多樣性,造成可讀框移動,出現翻譯終止密碼子而使蛋白質合成中止或產生新的蛋白質。是進化中出現新事物的一個源泉。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控
外顯子捕獲與擴增
? ? ? ? ? ? 實驗材料 大腸桿菌菌株 HB101 質粒 pSPL3 COS-7 細胞 載體 pBluescriptⅡ 大腸桿菌 DH5α
關于外顯子混編的介紹
當兩個轉座子被同一轉座酶識別而整合到染色體的臨近位置時，則它們之間的DNA將變得易于被轉座酶作用而轉座。如果它們之間的DNA中含有外顯子，則該外顯子將被切離，并可能插入另一基因之中。這種效應稱為外顯子混編。 即新的基因是由原來的基因打斷后的斷片混編而成的，或者是由編碼蛋白質結構域的基因片段混編
外顯子捕獲與擴增（三）
凝膠瓊脂糖凝膠（1.5%m/V), 用 TBE 配制核酸與寡核苷酸寡核苷酸引物 [20 mmol/L,TE(pH8.0) 配制]分別提取自轉染有對照載體和重組載體的 COS-7 細胞的 RNA(階段 3)。培養基含 50ug/ml 氨芐青霉素的 LB 瓊脂平板專用設備自動微量加樣器所用的加樣器尖頭微
全外顯子怎么看
全外顯子利用序列捕獲技術高通量測序的方法查看。全外顯子基因技術利用序列捕獲技術高通量測序的方法可將全基因組中所有外顯子區域DNA序列測序，可用于研究已知基因的單核苷酸多態性位點、插入缺失位點等。簡言之，外顯子就是指真核細胞的基因在表達過程中能編碼蛋白質的核苷酸序列，全外顯子基因檢測建議到正規醫院，專
外顯子捕獲與擴增1
本方案以哺乳動物穿梭載體 pSPL3 為例，描述了外顯子擴增的方法，內容分為以下五個階段。階段 1: 文庫的構建; 階段 2: 電穿孔法將文庫轉染 COS-7 細胞; 階段 3:mRNA 的提取; 階段 4: 反轉錄 PCR; 階段 5: 克隆分析。本實驗來源于分子克隆實驗指南（第三版）上冊，作者：
關于外顯子捕獲的簡介
外顯子捕獲(exon trapping) 是構建一種載體，從其插入片段中識別和回收外顯子序列，從而克隆目的基因。捕獲外顯子的載體pETV—SD是一種反轉錄病毒穿梭載體，即可在不同種生物中如大腸桿菌和酵母，細菌和哺乳動物細胞等進行復制的載體。因為凡是有內含子和外顯子的基因在轉錄后都要經過RNA剪接
外顯子捕獲與擴增2
階段 3:mRNA 的提取材料緩沖液與溶液按合適比例稀釋貯存液。DEPC 處理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚：氯仿無二價陽離子的磷酸緩沖液（PBS)SDS(5%m/V)TMK 緩沖液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X
關于全外顯子測序技術
在過去10年里，隨著高通量測序技術的出現與發展，科研與臨床醫學領域的遺傳學檢測范圍不斷擴大，檢測速度不斷加快。時至今天，DNA測序技術不僅推進了遺傳學研究，也被用于各種遺傳疾病的檢查。特別是利用全外顯子組測序（whole exomesequencing，WES）與全基因組測序（wholegenome
外顯子捕獲與擴增（一）
實驗材料 大腸桿菌菌株 HB101 質粒 pSPL3COS-7 細胞載體 pBluescriptⅡ大腸桿菌 DH5α試劑、試劑盒 pSPL3 多克隆位點圖譜限制性內切核酸酶PvuⅡT4DNA 連接酶LB 瓊脂平板黏粒載體TESOC 培養基瓊脂糖凝膠LB 肉湯培養基PBS胰酶-EDTA 溶液D
外顯子捕獲的操作步驟
(1)基因組DNA經“霰彈法”切成小片段后，克隆在位于“外顯子捕獲序列”下游的克隆位點上。(2)將這些重組載體匯總后感染反轉錄病毒的專宿包裝細胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2細胞系。ψ2細胞提供蛋白質產物使載體(自身不能合成病毒蛋白質)成
外顯子的操作步驟介紹
⑴基因組DNA經“霰彈法”切成小片段后,克隆在位于“外顯子捕捉序列”下游的克隆位點上。 ⑵將這些重組載體匯總后感染反轉錄病毒的專宿包裝細胞系（ecotropicretroviralpackagingcellline）——ψ2細胞系。ψ2細胞提供蛋白質產物使載體（自身不能合成病毒蛋白質）成為反轉
外顯子捕獲與擴增（二）
材料緩沖液與溶液按合適比例稀釋貯存液。無二價陽離子的磷酸緩沖液（PBS）酶及緩沖液胰酶-EDTA 溶液核酸與寡核苷酸DNA用于轉染的質粒 DNA 制備見本方案階段 1, 步驟 10~12。用作對照的質粒載體（步驟 3)培養基含 10% 熱滅活胎牛血清的 Dulbecco's modified
外顯子捕獲的操作步驟
(1)基因組DNA經“霰彈法”切成小片段后，克隆在位于“外顯子捕獲序列”下游的克隆位點上。(2)將這些重組載體匯總后感染反轉錄病毒的專宿包裝細胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2細胞系。ψ2細胞提供蛋白質產物使載體(自身不能合成病毒蛋白質)成
關于外顯子的應用機理介紹
應用聚合酶鏈反應-單鏈構象多態性（polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP）及DNA直接測序技術檢測68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外顯子。
關于外顯子的表達序列介紹
在反式剪接中,不同mRNA的外顯子可以被接合在一起。外顯子在剪接（Splicing）后仍會被保存下來,并可在蛋白質生物合成過程中被表達為蛋白質。外顯子是最后出現在成熟RNA中的基因序列,又稱表達序列。既存在于最初的轉錄產物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術語外顯子也指編碼相應RNA外
關于外顯子的結果應用介紹
結果發現68例SAD患者中有4例患者的SSCP發生泳動異常,DNA序列分析發現：這4例SAD患者的130號密碼子發了CTG→ATG錯義突變（388位點發生C→A突變）,使氨基酸由亮氨酸變為蛋氨酸（Leu130Met）；157號密碼子發生了GTG→CTG錯義突變（469位點發生G→C突變）,使氨基