關于RNA編輯的基本介紹
RNA編輯(RNA editing)是指轉錄后的RNA在編碼區發生堿基的加入、丟失或轉換等現象。RNA編輯產生的“基因”可稱為隱蔽基因( cryptogene),其產物的結構不能從基因組DNA序列中推導獲得。 早在1986年發現錐蟲線粒體mRNA轉錄加工后,其mRNA的多個編碼位置上加入或丟失尿苷酸。1990年在高等動物和病毒中也發現了上述現象,在有些蛋白質的表達過程中,發現有新的編碼序列產生或是編碼序列發生了改變,而且這種改變的發生不是在DNA水平上的,而是在RNA水平,通常會增加一些原來DNA模板中不曾編碼的堿基,這種現象是由RNA編輯所產生的。......閱讀全文
RNA編輯如何促進腫瘤生長?
最近一項新的研究,對于RNA(核糖核酸)編輯在癌癥中可能發揮的作用,提供了新的見解。這項研究結果發表在《Scientific Reports》雜志,可以讓我們進一步了解參與腫瘤發生和發展的一種新機制,并因此可能在未來帶來更好的治療方案。 在每一個健康的人體細胞中,連接到DNA中的遺傳信息,被轉
RNA探針的基本信息介紹
RNA探針是一類很有前途的核酸探針,由于RNA是單鏈分子,所以它與靶序列的雜交反應效率極高。早期采用的RNA探針是細胞mRNA探針和病毒RNA探針,這些RNA是在細胞基因轉錄或病毒復制過程中得到標記的,標記效率往往不高,且受到多種因素的制約。這類RNA探針主要用于研究目的,而不是用于檢測。例如,
信使RNA的基本信息介紹
信使RNA(mRNA)最早發現于1960年,在蛋白質合成過程中負責傳遞遺傳信息、直接指導蛋白質合成,具有以下特點。 1.含量低,占細胞總RNA的1%~5%。 2.種類多,可達105種。不同基因表達不同的mRNA。 3.壽命短,不同mRNA指導合成不同的蛋白質,完成使命后即被降解。細菌mRN
RNA聚合酶的基本介紹
RNA聚合酶(RNA polymerase):以一條DNA鏈或RNA為模板催化由核苷-5′-三磷酸合成RNA的酶。 催化轉錄的RNA聚合酶是一種由多個蛋白亞基組成的復合酶。如大腸桿菌的 RNA聚合酶有五個亞基組成,其分子量為480000,含有α,β,β’,σ,ω等5種不同的多肽,其中α為兩個分
RNA干擾回復實驗的基本介紹
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。 Off-target效應 Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can I
關于RNA沉默的分類介紹
植物中的RNA沉默根據作用靶標可以分為兩類: 以RNA為靶標, 使其降解或抑制蛋白翻譯, 稱為轉錄后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色質為靶標, 使其基因啟動子或組蛋白甲基化從而抑制 RNA 轉錄的起始, 稱為轉錄基因沉默(t
關于RNA干擾的發現介紹
RNAi是在研究秀麗新小桿線蟲(C. elegans)反義RNA(antisense RNA)的過程中發現的,由dsRNA介導的同源RNA降解過程。1995年,Guo等發現注射正義RNA(sense RNA)和反義RNA均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par-1基因的表達,該結果不能使用反義
關于反義RNA的來源介紹
細胞中反義RNA的來源有兩種途徑:第一是反向轉錄的產物,在多數情況下, 反義RNA是特定靶基因互補鏈反向轉錄產物, 即產生mRNA和反義RNA的DNA是同一區段的互補鏈。第二種來源是不同基因產物,如OMPF基因是大腸桿菌的膜蛋白基因,與透性有關,其反義基因MICFZE則為另一基因。
關于衛星RNA的特點介紹
Schneider(1969年)在煙草環斑病毒中首次發現了衛星RNA,他們通常有以下幾個特點: 1、多個衛星RNA分子可與輔助病毒基因組存在于同一衣殼中。 2、對宿主植物無獨立的侵染性。 3、其復制和包裝全部依賴于輔助病毒而后者不依賴于前者。 4、不具有mRNA活性。 5、與輔助病毒的
關于RNA剪接的定義介紹
RNA剪接是真核細胞基因表達中非常重要的一個生物過程,通過RNA剪接,可以產生許多具有功能的,帶有編碼信息的mRNA,它對生物的發育及進化至關重要。所以RNA剪接識別是正確理解基因表達過程的重要一步,而剪接的識別的關鍵是依賴于剪接位點的判定。真核細胞pre-mRNA的剪接位點處存在一定的序列保守
大腦RNA編輯位點“辭典”發布
美國西奈山伊坎醫學院研究人員對大腦中的數千個位點進行了編目,在這些位點中,RNA在整個人類生命周期中被修飾,這個過程被稱為腺苷到肌苷(A-to-I)編輯,其為理解大腦發育的細胞和分子機制以及它們如何影響健康和疾病提供了重要的新途徑。在《細胞報告》上發表的論文中,研究團隊描述了大腦中RNA編輯的速率如
RNA編輯技術治療嚴重罕見病
肌肉萎縮癥目前還沒有治愈的方法,患有這種疾病的兒童在早年失去了重要的肌肉力量。根據來自美國西北大學醫學院和芝加哥大學的一項最新研究,一種被稱為“外顯子跳躍(exon skipping)”的RNA編輯技術,在治療一種罕見而嚴重形式的肌肉萎縮癥的過程中,已經取得初步成效。相關研究結果發表在十月十二日
受體編輯的基本定義
前B細胞在骨髓中發育至不成熟B細胞,若后者的BCR能與骨髓細胞表面的自身抗原發生反應,則該細胞的成熟被阻滯,被阻滯細胞通過Ig輕鏈基因重組,轉換機制可改變其受體特異性,這個過程稱為受體編輯。
關于RNA的自我復制的介紹
進一步的研究還發現一些RNA病毒如R17、f2、MS2等,可以以RNA為模板直接復制新的RNA。這些病毒都屬于最簡單的類型。例如,MS2的RNA只含有大約350個核苷酸,僅編碼三種蛋白質:外殼蛋白,附著蛋白(attachment protein,其功能主要是使病毒能附著于寄主細胞并進入其內部)、
關于衛星RNA的加工的介紹
在具侵染性小分子RNAs的復制機制中,RNA的加工最令學者們興趣,即是在多聚體形式與相關的線狀和環狀單體之間的切割與連接過程。1986年有學者發現煙草環斑病毒ToRSV與衛星RNA 正鏈二聚體在接點處自我切割,產生具有感染性的線狀單休。隨后,又發現包含有ASBV的正鏈與負鏈的二聚體的體外轉錄休能
單鏈RNA的基本信息介紹
一般來說生物學家是根據RNA能否直接起mRNA作用而分成正鏈ssRNA病毒與負鏈ssRNA病毒兩種。 (1)正鏈RNA病毒(如脊髓灰質炎病毒)的ssRNA可直接起mRNA作用,轉譯早期蛋白質,包括RNA多聚酶和抑制宿主細胞合成代謝的調控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下,以ssRNA(正鏈)為模板
浙大:RNA編輯阻止RISC識別靶標mRNA
MicroRNAs(miRNAs)結合Ago形成RNA誘導沉默復合體,通過沉默靶mRNA調控基因表達。miRNA的RNA編輯可能影響miRNA的加工,Ago復合物的組裝,以及靶mRNA的結合。然而,組裝進Ago復合物的被編輯的miRNA的功能,還沒有被深入研究過。 浙江大學生命科學學院章曉波教
Cancer-Research:RNA編輯與食管癌
科學家們首次在食管鱗狀細胞癌中發現,負責編輯RNA的酶發生過表達,促進了癌癥的發展。 食管鱗狀細胞癌ESCC(Esophageal Squamous Cell Carcinoma)是食管癌的一種主要類型。新加坡國立大學NUS的科學家們發現,RNA 腺苷脫氨酶1(ADAR1)可以作為
張建之教授PNAS解析RNA編輯
如果一些編碼位點的RNA編輯受損,就會引起嚴重的疾病。因此,一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。 近年來的基因組研究顯示,人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。 現在
關于小干擾RNA的結構介紹
siRNA具有明確定義的結構:具有磷酸化5'末端的短(通常20至24bp)雙鏈RNA(dsRNA)和具有兩個突出核苷酸的羥基化3'末端。該切酶酶催化生產的siRNA由長的dsRNA和小發夾RNA。siRNA也可以通過轉染引入細胞。由于原則上任何基因都可以被具有互補序列的合成siR
關于小干擾RNA的發現介紹
siRNA最早是由英國的大衛·包孔博(David Baulcombe)團隊發現,是植物中的轉錄后基因沉默(post-transcriptional gene silencing;PTGS)現象的一部分,其研究結果發表于《科學》。2001年,湯瑪士·涂許爾(Thomas Tuschl)團隊發現合成
關于RNA干擾的作用機制介紹
病毒基因、人工轉入基因、轉座子等外源性基因隨機整合到宿主細胞基因組內,并利用宿主細胞進行轉錄時,常產生一些dsRNA。宿主細胞對這些dsRNA迅即產生反應,其胞質中的核酸內切酶Dicer將dsRNA切割成多個具有特定長度和結構的小片段RNA(大約21~23 bp),即siRNA。siRNA在細胞
關于微RNA的歷史發現介紹
MicroRNA(miRNA)是一類內生的、長度約20-24個核苷酸的小RNA,其在細胞內具有多種重要的調節作用。每個miRNA可以有多個靶基因,而幾個miRNAs也可以調節同一個基因。這種復雜的調節網絡既可以通過一個miRNA來調控多個基因的表達,也可以通過幾個miRNAs的組合來精細調控某個
新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化
在一項新的研究中,來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用堿基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,論文標題為“Analysis and minimization of cellular RNA
基因編輯大牛張鋒開發出RESCUE技術,可擴大RNA編輯能力
基于CRISPR的工具徹底改變了我們靶向與疾病相關的基因突變的能力。CRISPR技術包括一系列不斷增長的能夠操縱基因及其表達的工具,包括利用酶Cas9和Cas12靶向DNA,利用酶Cas13靶向RNA。這一系列工具提供了處理突變的不同策略。鑒于RNA壽命相對較短,靶向RNA中與疾病相關的突變可避
基因編輯鼠的構建-Guide-RNA設計和篩選
眾所周知,CRISPR/Cas9被業內譽為“基因剪刀”,它可以高效地實現靶基因的編輯,自問世以來就備受關注和青睞。CRISPR/Cas9系統是由CRISPR相關基因和Cas9組成,Cas9核酸酶會在向導RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因組上的特定位點完成切割反應,同
關于反義RNA的注意點的介紹
[1]長的反義RNA并不一定比短的反義RNA更為有效; [2]在原核生物中針對SD序列及其附近區域的反義RNA可能更有效; [3]在真核生物中,對應于5'端非編碼區的反義RNA可能比針對編碼區的反義RNA更有效; [4]盡量避免在反義RNA分子中出現自我互補的二級結構; [5]設
核內不均一RNA的基本介紹
核內不均一RNA,在真核細胞核內可以分離到一類含量很高,分子量很大但不穩定的RNA,稱為核內不均一RNA(heterogeneous nuclear RNA,hnRNA),其平均分子長度為8-10Kb,長度變化的范圍從2Kb左右到14Kb左右,比mRNA的平均長度(1.8-2Kb)要大4-5倍。
RNA探針的基本介紹和重要意義
RNA探針是一類很有前途的核酸探針,由于RNA是單鏈分子,所以它與靶序列的雜交反應效率極高。早期采用的RNA探針是細胞mRNA探針和病毒RNA探針,這些RNA是在細胞基因轉錄或病毒復制過程中得到標記的,標記效率往往不高,且受到多種因素的制約。這類RNA探針主要用于研究目的,而不是用于檢測。例如,
Nature重大突破:CRISPR也可編輯RNA
一種用來編輯基因組中DNA指令的強大科學工具現在也可以應用于RNA。來自加州大學伯克利分校和勞倫斯伯克利國家實驗室的一個研究人員小組,證實借助于一種方法可以編程CRISPR/Cas9蛋白復合物在序列特異性的靶位點識別并切割RNA。這一研究發現有可能改變RNA功能研究的模式,為檢測、分析和操控RN