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  • 一致性序列的概念

    一致序列:在兩個或多個同源序列的每一個位置上多數出現的核苷酸或氨基酸組成的序列。......閱讀全文

    簡單序列長度多態性的概念

    簡單序列長度多態性是據串聯重復排列微衛星基序兩側的單一序列設計引物,對微衛星序列(microsatellite DNA或simple sequence repeats,SSR)進行擴增,由微衛星基序重復數目的變異而產生多態性。

    核苷酸序列的基本概念

    由A、T、C、G四種字符組成的核苷酸序列本質上是生物分子的一種符號表示。在計算生物學中,常采用離散傅立葉變換進行頻譜分析。

    單一序列的概念和結構

    單一序列(unique sequence)又稱非重復序列, 在一個基因組中一般只有一個拷貝。真核生物的絕大多數結構基因在單倍體中是單拷貝或幾個拷貝(1~5個拷貝)。

    簡單重復序列多態性的概念和應用

    中文名稱簡單重復序列多態性英文名稱simple sequence repeat polymorphism;SSRP定  義由組成比較簡單的(如二、三核苷酸或四核苷酸序列)串聯重復所具有的拷貝數不同而造成的多態現象。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)

    液相色譜法術語概念洗脫序列

    洗脫序列( elutropic series)根據溶劑強度參數由小到大排列的順序。

    清華大學團隊提出蛋白質序列功能空間壓縮的概念

    蛋白質作為最重要的生命構建單元之一,其序列和功能之間的映射(適應性景觀,Fitness landscape)的針對性研究對于蛋白質理性設計以及工程應用都有極大的意義。目前人們只能對于蛋白質序列-功能關系進行少量低緯度的點采樣,例如深度突變搜索(DMS)、單位點飽和突變等,或是利用隨機建庫等方式以極低

    設計引物用cds序列和cdna序列的區別

    cDNA和mRNA的序列是互補的,如果用兩個引物,最后的兩條DNA序列分別對應于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向從5‘至3’,所以兩個引物對應于mRNA和cDNA中相應序列即可。

    前導序列

    中文名前導序列外文名leader sequence前導序列是結構基因中編碼區之前的一段序列,這部分序列能被轉錄,但不被翻譯,在mRNA是從5′端起至結構基因第一編碼子開始點(通常 AUG)為止,在蛋白質合成過程中不被翻譯。

    RGD序列的定義

    RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸組成,存在于多種細胞外基質中,可與11種整合素特異性結合,能有效地促進細胞對生物材料的粘附。

    RGD序列的用途

    該序列肽能夠競爭性抑制包括纖維蛋白在內的各種粘附蛋白與血小板的結合,可達抑制血小板與纖維蛋白結合的目的,有較好的臨床研究價值。

    AluI序列的定義

    人基因組約有50萬~70萬份拷貝,AluI序列長282個核苷酸,由兩個同源但略有差別的亞基組成。

    互補序列的定義

    中文名稱互補序列英文名稱complementary sequence定  義在雙鏈核酸中,一條多核苷酸鏈可與另一條多核苷酸鏈互補的那部分序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)

    SD序列的作用

    SD序列的作用是與16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列結合,小亞基16S rRNA的3'端的這個小片段就被稱為反SD序列。當mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列結合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白質合成的起始密碼子。

    核酸序列分析

    【實驗目的】1、?掌握已知或未知序列接受號的核酸序列檢索的基本步驟;2、?掌握使用BioEdit軟件進行核酸序列的基本分析;3、?熟悉基于核酸序列比對分析的真核基因結構分析(內含子/外顯子分析);4、?了解基因的電子表達譜分析。【實驗原理】針對核酸序列的分析就是在核酸序列中尋找基因,找出基因的位置和

    核酸序列的檢索實驗

    實驗方法原理掌握核酸序列檢索的操作方法;熟悉GenBank數據庫序列格式及其主要字段的含義;了解EMBL數據庫序列格式及其主要字段的含義;熟悉GenBank數據庫序列格式的FASTA序列格式顯示與保存;實驗材料電腦儀器、耗材筆記本筆實驗步驟1. ?使用Entrez信息查詢系統檢索核酸序列BC0608

    RGD序列的結構特點

    RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸組成,存在于多種細胞外基質中,可與11種整合素特異性結合,能有效地促進細胞對生物材料的粘附。

    質粒維持序列的定義

    中文名稱質粒維持序列英文名稱plasmid maintenance sequence定  義存在于重組質粒中的、與保持其在宿主中穩定復制有關的序列。如乳酸菌質粒pGT232的一段由雙鏈復制起點和編碼復制起始蛋白repA的基因所組成的1.7 kb的序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與

    間插序列的定義

    中文名稱間插序列英文名稱intervening sequence;IVS定  義基因間或基因內的非編碼序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

    常用的βactin-引物序列

    human actin f ctc cat cct ggc ctc gct gt?human actin r gct gtc acc ttc acc gtt cc?product size:268?rabbit actin r agt gcg acg tgg aca tcc g?rabbit act

    SD序列的翻譯影響

      一般來說,mRNA與核糖體的結合程度越強,翻譯的起始效率就越大,而這種結合程度主要取決于SD序列與16S rRNA的堿基互補性,其中以GGAG 4個堿基序列尤為重要。其中,大腸桿菌的SD序列為AGGAGGU。對多數基因而言,這4個堿基中任何一個換成C或T,均會導致翻譯效率大幅度降低。SD序列與起

    表達序列標簽的方法

    首先從樣品組織中提取mRNA,在逆轉錄酶的作用下用oligo(dT)作為引物進行RT-PCR合成cDNA,再選擇合適的載體構建cDNA 文庫,對各菌株加以整理,將每一個菌株的插入片段根據載體多克隆位點設計引物進行兩端一次性自動化測序,這就是EST序列的產生過程。

    反向重復[序列]的定義

    存在于雙鏈核酸分子中排列順序方向相反的一段核苷酸序列。

    匹配序列的結構特點

    中文名稱匹配序列英文名稱matched sequence定  義在序列排比中,兩條多核苷酸鏈或兩條多肽鏈上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)

    串聯重復[序列]的定義

    中文名稱串聯重復[序列]英文名稱tandem repeat定  義首尾相連的重復序列。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)

    表達序列標簽的應用

    EST作為表達基因所在區域的分子標簽因編碼DNA序列高度保守而具有自身的特殊性質,與來自非表達序列的標記(如AFLP、RAPD、SSR 等)相比更可能穿越家系與種的限制,因此EST標記在親緣關系較遠的物種間比較基因組連鎖圖和比較質量性狀信息是特別有用。同樣,對于一個DNA序列缺乏的目標物種,來源于其

    停止轉移序列的定義

    停止轉移序列(stop transfer sequence),肽鏈上的一段特殊序列,與內質網膜的親合力很高,能阻止肽鏈繼續進入內質網腔,使其成為跨膜蛋白質。

    SD序列的形成過程

    在原核生物中,起始密碼子的選擇取決于核糖體的小亞基與mRNA模板之間的相互作用。30S亞基與處于緊靠正確起始密碼子上游的富含嘌呤的mRNA模板結合,這個區稱為SD序列(Shine—Dalgarno sequence),它與16S rRNA 3'端的一個富含嘧啶區互補。在起始復合物形成過程中,

    常用的βactin-引物序列

    human actin f ctc cat cct ggc ctc gct gt?human actin r gct gtc acc ttc acc gtt cc?product size:268?rabbit actin r agt gcg acg tgg aca tcc g?rabbit act

    簡述SD序列的作用

      SD序列的作用是與16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列結合,小亞基16S rRNA的3'端的這個小片段就被稱為反SD序列。當mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列結合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白質合成的起始密碼子。

    SD序列的形成過程

    在原核生物中,起始密碼子的選擇取決于核糖體的小亞基與mRNA模板之間的相互作用。30S亞基與處于緊靠正確起始密碼子上游的富含嘌呤的mRNA模板結合,這個區稱為SD序列(Shine—Dalgarno sequence),它與16S rRNA 3'端的一個富含嘧啶區互補。在起始復合物形成過程中,

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