前言
RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程,目前對m6A
RNA甲基化的研究已進行的如火如荼,但除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達,其中包括m5C甲基化修飾在近期的研究中也不斷有高分文章的出現(如表1)。云序生物是國內RNA修飾測序的領跑者,可針對mRNA和各種非編碼RNA提供各類RNA修飾測序服務
(m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前,云序已累計支持客戶發表29篇高水平文章,合計影響因子191.25分,是國內支持發文多、累計影響因子高的公司。
2020年10月,發表在《Trends in Plant
Science》上關于m5C的文章對m5C修飾在植物發育和環境適應中的作用進行了闡述。此外也有多篇文章報道了m5C在眾多研究方向的機制。那么這個新領域具體有哪些進展?有哪些新型的方法思路值得我們借鑒呢?小編匯集了多篇m5C修飾文章,帶大家把握這一領域的新進展。
文章內容
1. m5C——m5C修飾的控制植物發育和環境適應
發表期刊:Trends in Plant Science
影響因子:14.416
發表時間:2020.10
文章鏈接:RNA5-Methylcytosine Controls Plant Development and Environmental Adaptation
盡管對RNA上的5-甲基胞嘧啶(m5C)在哺乳動物中的研究越來越多,但m5C在植物中的功能仍然不清楚。先前有研究者提出了m5C在植物發育和脅迫適應中的動態功能,此外Tang等研究者現在已經發現RNA
m5C甲基轉移酶在水稻高溫適應中的作用。目前,已有幾種新的方法被應用于RNA m5C的鑒定包括MeRIP-seq,RNA-BisSeq,
Aza-IP和miCLIP,其中最后兩個方法尚未應用于植物。最近使用m5C-RIP-seq、RNA-
Bis-seq和Nanopore-seq研究了m5C表達譜及其在植物RNA代謝、發育和應激反應中的作用。本文通過m5C在擬南芥和水稻mRNA中的位置、功能和靶向性的探討,表明了m5C在擬南芥和水稻根系發育調控中起著至關重要的作用。

圖例:5-Methylcytosine (m5C)修飾及其在植物發育和環境適應中的作用。
2. m5C——m5C修飾的mRNA造成DNA損傷促進了同源重組
發表期刊:Nature Communications
影響因子:12.121
發表時間:2020.06.05
文章鏈接:m5C modification of mRNA serves a DNA damage code to promote homologous recombination
補充DNA修復蛋白到DNA損傷部位是DNA修復的關鍵步驟。DNA損傷位點的轉錄后修飾造成DNA錯誤編碼從而招募了特定的DNA修復因子。文中作者發現m5C在DNA損傷位點對mRNA進行了局部修飾。RNA甲基轉移酶TRDMT1被招募到DNA損傷位點并促進m5C的修飾。TRDMT1的缺失破壞了同源重組(HR)并增加了細胞對DNA雙鏈斷裂(DSBs)的敏感性。在沒有TRDMT1的情況下,RAD51和RAD52無法定位到活性氧(ROS)誘導的DNA損傷位點。在體外,含有m5C修飾的RAD52對DNA的親和力增強。腫瘤細胞中TRDMT1的缺失使其在體內和體外對PARP抑制劑更敏感。這些結果揭示了TRDMT1-
m5C修飾能促進同源重組(HR),說明RNA轉錄后修飾也可以造成DNA損傷從而調節DNA修復。

圖例:m5C mRNA的甲基化富集于DNA損傷的轉錄活性位點。