mirna的熒光定量pcr可以用actin做內參
miRNA通過與轉錄本的相互作用,關閉或抑制基因的表達。
最近的研究表明它們影響了約三成的基因。
miRNA在多個組織中差異表達,這就讓表達圖譜分析成為研究的重點。
同時,miRNA的過表達和抑制也是近年來常用的研究方法。
我知道和使用過的U6內參基因只有兩個:RNU6-1和RNU6-2.前一個就是常見的u6,后一個有時被稱為u6b.在我的大鼠RNA樣本當中,u6表達量有些太高,u6b的Cq值與我的目標miRNA比較接近,穩定性也很好.但是這些對植物樣本中的內參基因選擇沒有什么指導意義.
為了確定u6在植物中的保守性,比較快捷的辦法是找到談論這個話題的文獻綜述.如果沒有人寫過這樣的綜述的話,就只能靠自己去數據庫找到所有序列自己對比了.
關于內參基因的選擇,必須實驗確定特定樣本中的表達水平穩定,其他文獻中報導的內參基因不一定適合你的樣本.做新的課題時,選擇內參基因一般是選取3-5個常用的,PCR測試后選取.
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