pBR322與pUC質粒載體相比優點

（1）具有更小的分子量和更高的拷貝數

如pUC8為2 750bp，pUCl8為2 686bp，控制質粒復制rop基因的缺失，平均每個細胞即可達500～700個拷貝

（2）適用于組織化學法檢測重組體

通過a-互補作用，利用菌落顏色篩選重組子。

（3）具有多克隆位點區段（MCS）

可以定向克隆防止載體自我連接。