SDS-PAGE電泳可用于分離蛋白質和核苷酸
,這里綜述了SDS-PAGE實驗原理、試劑和器材、以及實驗操作步驟。
一.
實驗原理:
SDS-PAGE是對蛋白質進行量化,比較及特性鑒定的一種經濟、快速、而且可重復的方法。該法是依據混合蛋白的分子
量不同來進行分離的。
SDS是一種去垢劑,可與蛋白質的疏水部分相結合,破壞其折疊結構,并使其廣泛存在于一個廣泛均一的溶液中。SDS蛋白質復合物的長度與其分子
量成正比。在樣品介質和凝膠中加入強還原劑和去污劑后,電荷因素可被忽略。蛋白亞基的遷移率取決于亞基分子量。
二.
試劑和器材:
試劑:1.
5x樣品緩沖液(10ml):0.6ml
1mol/L的Tris-HCl(pH6.8),5ml
50%甘油,2ml
10%的SDS,0.5ml巰基乙醇,1ml
1%溴酚藍,0.9ml蒸餾水。可在4℃保存數周,或在-20℃保存數月。
2.
凝膠貯液:在通風櫥中,稱取丙烯酰胺30g,甲叉雙丙烯酰胺0.8g,加重蒸水溶解后,定容到100ml。過濾后置棕色瓶中,4℃保存,一般可放置1個月。
3.
pH8.9分離膠緩沖液:
Tris
36.3g
,加1mol/L
HCl
48ml,加重蒸水80ml使其溶解,調pH8.9,定容至100ml,
4℃保存。
4.
pH6.7濃縮膠緩沖液:
Tris
5.98g
,加1mol/L
HCl
48ml,加重蒸水80ml使其溶解,調pH6.7,定容至100ml,
4℃保存。
5.
TEMED(四乙基乙二胺)原液
6.10%過硫酸銨(用重蒸水新鮮配制)
7.
pH8.3
Tris-甘氨酸電極緩沖液:稱取Tris
6.0g,甘氨酸28.8g,加蒸餾水約900ml,調pH8.3后,用蒸餾水定容至1000ml。置4℃保存,臨用前稀釋10倍。
8.
考馬斯亮藍G250染色液:稱100mg考馬斯亮藍G250,溶于200ml蒸餾水中,慢慢加入7.5ml
70%的過氯酸,最后補足水到250ml,攪拌1小時,小孔濾紙過濾。
器材:電泳儀
,電泳槽,水浴鍋,搖床。
三.
實驗操作;
1.
樣品制備
將蛋白質樣品與5X樣品緩沖液(20ul+5ul)在一個eppendorf
管中混合。放入100℃加熱5-10min,取上清點樣。
2.
分離膠及濃縮膠的制備
①
將玻璃板、樣品梳、Spacer用洗滌劑洗凈,用ddH2O沖洗數次,再用乙醇擦拭,晾干;
②
將兩塊洗凈的玻璃板之間加入Spacer,按照Bio-Rad
Mini
Ⅱ/Ⅲ說明書提示裝好玻璃板;
③
按如下體積配制10%分離膠8.0
ml,混勻:ddH2O
3.0
ml;1.0
mol/LTris-HCl
pH=8.8
2.1
ml;30%
Acr-Bis
2.8
ml;10%
SDS
80
ul;10%AP
56
ul;TEMED
6
ul。
④
向玻璃板間灌制分離膠,立即覆一層重蒸水,大約20
min后膠即可聚合;
⑤
按如下體積配制6%濃縮膠3.0
ml,混勻:ddH2O
1.0
mol/LTris-HClpH=6.8
30%
Acr-Bis;2.0
ml
400
ul
600
ul;10%
SDS
10%
AP
TEMED;36ul
24ul
4ul。
⑥
將上層重蒸水傾去,濾紙吸干,灌制濃縮膠,插入樣品梳;
⑦
裝好電泳系統,加入電極緩沖液,上樣20
μl;
⑧
穩壓200V,溴酚藍剛跑出分離膠時,停止電泳,約需45
min~1hr.
⑨
卸下膠板,剝離膠放入染色液中,室溫染色1~2
hr;加入脫色液,置于80
rpm脫色搖床上,每20
min更換一次脫色液(10
ml
冰乙酸;45
ml乙醇;45
ml蒸餾水)至完全脫凈。
聚丙烯酰胺凝膠具有分子篩效應,可根據蛋白亞基分子量不同將分離蛋白,SDS-PAGE電泳凝膠好壞直接關系到電泳能否成成,一般濃縮膠和分離膠的pH分別是6.7和8.9.