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tBA轉錄組數據基礎分析
發布時間:2019-08-11 21:07 原文鏈接:
tBA轉錄組數據基礎分析
本公司采用自主研發與成熟開源軟件相結合的方式構建了專業高效的生物信息分析流程,對您獲得的海量
RNA-seq
序列的質量和多種重要信息進行圖形可視化。
我們的流程:
1.
Pretreatment
(有效序列Reads提取)
l
高通量測序質量評估,獲得測序有效讀長。
l
剔除每條序列中的index序列和adaptor序列。
l
獲得有效序列總數。
2.
Mapping (
全基因組定位):讓您“看見”自己樣品中mRNA和ncRNA的分布狀態。
l
Reads mapping: total mapped, unique mapped, multiple mapped.
l
Genomic distribution of the mapped reads
。包括不同基因區域分布分析:
(1)mRNA and ncRNA region
(2)sense and antisense region
(3)5’UTR, CDS, 3’UTR, intron, intergenic region
3.
mRNA coverage analysis
(mRNA覆蓋度和特征分析 ):讓您“看見”自己樣品中mRNA的質量和特征。
l
盒須圖分析mRNA不同區的reads coverage,以intron區作對照。
l
Read
在均一化的mRNA上的分布圖。
4.
Expression analysis (mRNA
表達量分析):讓您“看見”自己樣品中每個基因的表達量。
l
通過嚴格的標準化獲得您樣品中每個基因的可信表達豐度。
l
根據表達豐度對您樣品中的基因分布趨勢進行可視化。
我們的承諾:
l
提交您專業的項目結題報告。
l
普通項目完成時間一般為2-3個工作日。
您需要提供的樣品:
如果您的RNA-seq過程不是在本公司完成,請您提供原始測序數據,樣品介紹,以及您的項目需求。分析結果的可信度和深度依賴于您的測序質量和有效reads的數量。
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