tRNA的二級結構如圖1所示，其在原核生物和真核生物均相對保守。主要結構有D-loop（D環）、T（C）-loop（T環）、Anticodon-loop（反密碼子環）、Accepter Arm（受體臂）、3'端CCA保守序列、Discriminator（識別堿基）、Variable-loop（可變環）等。
由于翻譯的氨基酸需要，tRNA在單個細胞內可有很多種，下面將討論各種mRNA之間的保守部分和可變部分。
