tunnel 的凋亡染色并不是專門去染細胞核，但它可以使細胞核著色。
TUNEL全名為terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling漢語為：脫氧核糖核苷酸末端轉移酶介導的缺口末端標記法。原理：細胞凋亡中, 染色體DNA雙鏈斷裂或單鏈斷裂而產生大量的粘性3’末端，可在脫氧核糖核苷酸末端轉移酶(TdT)的作用下，將脫氧核糖核苷酸和熒光素、過氧化物酶、堿性磷酸酶或生物素形成的衍生物標記到DNA的3’末端，從而可進行凋亡細胞的檢測。由于正常的或正在增殖的細胞幾乎沒有DNA的斷裂，因而沒有3’末端形成，很少能夠被染色。
TUNEL實際上是分子生物學與形態學相結合的研究方法，對完整的單個凋亡細胞核或凋亡小體進行原位染色，能準確地反應細胞凋亡典型的生物化學和形態特征，可用于石蠟包埋組織切片、冰凍組織切片、培養的細胞和從組織中分離的細胞的細胞形態測定，并可檢測出極少量的凋亡細胞，因而在細胞凋亡的研究中被廣泛采用.