WB實驗是通過聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)將混合蛋白質樣品分離后,利用特殊虹吸或電場裝置印跡至固相介質(例如PVDF膜)上。
再以固相載體上的蛋白質或多肽作為抗原,與相對應的第一抗體特異性結合,之后再與酶或同位素標記的第二抗體相結合,最終通過底物顯色或放射自顯影來檢測特異性目的基因表達的蛋白成分。