[挖個墳]Omicron的毒力之謎，謎底終于揭曉

　　各位，話說去年12月1號，

　　也就是Omicron剛剛面世一周的時候，

　　咱公眾號發過一篇文章，

　　請見：《請各位稍安勿躁，不要搶跑……》;

　　然后到了2022年1月1日，

　　咱又寫了個后續，

　　請見：《Omicron的毒力之謎》。

　　剪斷截說，上邊第一篇文章，

　　針對的是當時一個很不正常的情況：

　　Omicron(BA.1)在2021年11月24日才正式現形，

　　短短一周之后的12月1號，關于它的一切數據都還沒有實錘，也不可能那么快就拿到實錘。(以上數據包括但不限于：傳染性、指數增長率、毒力、病死率、續發率、潛伏期、代際間隔、序列間隔、免疫逃逸能力、疾病表型等等)。

　　但當時市面上，卻已然出現了漫山遍野的“MILD”論調。

　　所以那篇文章正如標題所述，

　　就是號召大家冷靜冷靜，不要搶跑~

　　隨意搶跑容易被人賣了還幫人數錢。

　　然而很遺憾，咱作為一個關注人數還不到十萬的匿名公眾號，

　　影響力顯然不足以扭轉這股子反智狂潮，

　　“MILD”這個刻板印象毫不意外地建立了起來。

　　于是一個月之后，眼看著大伙兒搶跑搶得不亦樂乎，

　　咱忍不住跟著跳下場搶跑了一把，

　　搗鼓出第二篇文章。

　　第二篇匯總了當時市面上已有的一些初步數據，

　　針對Omicron(BA.1)的毒力、致病性、傳染性等參數，吃了幾口不太熟的瓜。

　　總結總結就是：

　　Omicron(BA.1)的內生毒力(以入院風險計)比Delta低30%左右;

　　Omicron(BA.1)的內生毒力(以入院風險計)強于原始株，也強于直接祖先B.1.1，甚至略強于同屬B.1.1子毒株的Alpha;

　　Omicron(BA.1)病死率和重癥風險減低的原因，主要是疫苗接種和既往感染史，而不是內生毒力轉變;

　　Omicron(BA.1)在肺部復制效率降低的原因，主要是組織嗜性轉變，因此不能只憑肺嗜性來評估致病性;

　　Omicron(BA.1)內生傳染性(以R0計)和Delta相仿;

　　Omicron(BA.1)相對Delta更有傳播優勢的原因，主要是免疫逃逸能力和代際間隔。

　　說實話，吃生瓜這種事兒，

　　咱還真不是太拿手，

　　所以當時的心情是略為忐忑的，

　　畢竟上述某些說法，

　　和市面上的主流論調完全相悖~

　　特別是“內生毒力強于原始株/B.1.1/Alpha”這一條，

　　說是冒天下之大不韙也不為過~

　　并且吧，由于全球范圍的集體拉胯，

　　Omicron的內生毒力，遲遲沒法拿到實錘~

　　雖然關于Omicron入院風險、重癥風險、病死率等方面的研究可以說多如牛毛了已經，

　　但由于某些眾所周知的拉胯原因，

　　絕大多數這類研究都沒有好好地控制既往感染史，

　　也不可能控制既往感染史，

　　所以在這種情況下，Omicron的毒力必然是被顯著低估的~

　　直到……香港也跟著拉胯了。

　　長話短說，

　　隨著香港第五波疫情熬過高峰期，

　　港大的總結性paper終于低調登場了，

　　關于Omicron內生毒力的實錘，似乎終于可以落地了。

　　——請品鑒：

　　標題翻譯成人話：

　　新冠病毒Omicron BA.2子毒株在香港的感染流行病學研究，2022年1-3月

　　雖然還只是新鮮出爐的預印本狀態，

　　但有港大梁老師和Cowling老師等各位大佬坐鎮，

　　想必數據質量是有保障的。

　　至于為啥咱對之前多如牛毛的那些研究看都不看，

　　偏偏要拿港大這個預印本說事兒呢?

　　原因很簡單，在第五波之前：

　　香港是全球極少有的，全民幾乎沒有感染過新冠病毒的處女地;

　　同時，香港還擁有不少未接種人口。

　　所以咯，香港的Omicron毒力/致病性數據，

　　是截至目前獨一無二的，

　　幾乎不受既往感染史污染的數據，

　　所以也就是最接近病原體內生狀態的數據。

　　(當然了，還是有一丟丟不足……短命的BA.1消失得實在太快，香港給出來的，已然是以BA.2.2為主的數據~)

　　——總之，請品鑒：

　　紅框部分翻譯成人話：

　　雖然Omicron在動物模型實驗中表現出了更低的致病性，并且在南非以及其他地區表現出了更低的重癥風險，但是，我們發現在香港第五波的早期階段，Omicron在未接種疫苗的人群中造成了與之前幾波相仿的病死率。因此BA.2的內生重癥風險也許并沒有顯著低于原始株，或者完全不低于原始株。總結總結啊，

　　梁老師他們一步到位，直接用了實錘程度最高的病死率來表征BA.2的內生毒力;

　　至于為啥只用“第五波早期階段”的病死率?因為香港第五波早期階段的確診門檻和前面四波完全一致。但由于疫情糜爛，檢測能力所限，第五波中后期的確診門檻有所拔高，因此可能會影響病死率;

　　所謂的“前四波”，詳見下圖，以Alpha為主，也包括其他早期毒株(見下圖);

　　梁老師他們還提到，第五波早期階段除了BA.2.2之外，還夾雜了少量的Delta(詳見：《香港，倉鼠的末路》)，所以Omicron的病死率可能有少量高估;

　　不過梁老師他們沒提到的是，前四波除了原始株和Alpha之外，也夾雜了少量的Beta和Mu，所以病死率可能也有少許高估。

　　——總之，前四波大概是這么個造型，請品鑒：

　　——第五波則是這么個造型，請再品鑒：

　　重申一句，為了避免不受控爆發期對病死率的影響，

　　梁老師他們只選取了紅框部分的死亡人數，

　　作為Omicron代表隊出面和前面四波PK。

　　——最后結果，請品鑒(可能需要點開大圖)：

　　以上綠色數字和黃色數字，分別是前四波的病死率和第五波未完全接種病例的病死率(已根據年齡分層)。

　　所以在沒有既往感染史和疫苗拉偏架的情況下，

　　第五波的病死率，在六個年齡組當中的三個都高于前四波。

　　并且吧，嚴格來說第五波的病死率，還是被疫苗拉了一點偏架。

　　畢竟梁老師他們只排除了“完全接種”的病例，

　　而在第五波早期，香港還有全人口7%左右已經部分接種，

　　這7%的第一針，顯然也能降低一丟丟病死率~

　　——總之，咱換個角度品鑒：

　　以上縱軸是病死率，橫軸是年齡分層;

　　藍色圓點=前四波死亡病例、

　　紅色三角形=第五波未完全接種的死亡病例，

　　綠色菱形=第五波已完全接種死亡病例。

　　——所以顯而易見，最終結果正如咱1月初搶跑的一樣：

　　驚不驚喜意不意外?

　　并且吧，以上結果的焦慮之處就在于，

　　我們已經知道，

　　Omicron它真的有好幾項可能導致減毒的機制，

　　比如更低的肺嗜性，

　　比如更低的FCS酶切效率，

　　再比如更低的合胞效率。

　　可是梁老師帶給咱們的最終實錘結論卻是：

　　這玩意兒內生毒力跟原始株/Alpha打成平手(實際上還略高一丟丟)……

　　那么它到底靠什么咱們不知道的機制彌補回了毒力?

　　(賣個關子，過兩天詳細八卦)

　　最后，梁老師他們這個預印本的主要賣點，

　　其實并不是香港第五波早期階段的病死率，

　　——而是這個：

　　翻譯成人話：

　　BA.1的中位數序列間隔3.15天、中位數代際間隔2.38天;

　　BA.2的中位數序列間隔2.17天(代際間隔沒算出來)。

　　——作為對比：

　　在2021年5月份廣州疫情期間，Delta的中位數代際間隔和序列間隔都是3天~

　　以上預印本原文請見：

　　Epidemiology of infections with SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant in Hong Kong, January-March 2022

　　Yonatan Mefsin, Dongxuan Chen, Helen S. Bond, Yun Lin, Justin K. Cheung, Jessica Y. Wong, Sheikh Taslim Ali, Eric H. Y. Lau, Peng Wu, Gabriel M. Leung, Benjamin J. Cowling

　　medRxiv 2022.04.07.22273595;

　　doi: https://doi.org/10.1101/2022.04.07.22273595